label_copy = 255 * np.ones(label.shape, dtype=np.float32)
时间: 2023-11-13 13:04:29 浏览: 128
这段代码创建了一个和原始标签(label)形状相同的标签副本(label_copy),并将其中的每个元素都赋值为 255。具体来说,它使用了 NumPy 库中的 ones 函数,创建了一个全为 1 的数组,并乘以 255,将其转换为全为 255 的数组。这个数组的数据类型是 np.float32,因为在后续的代码中,我们会将这个数组中的某些元素赋值为整数,因此需要使用浮点数类型。这个标签副本的作用是用于存储转换后的标签,其中 255 表示未分类区域。在 Cityscapes 数据集中,原始标签中的一些类别可能不在我们需要的训练集中(例如一些细粒度的类别),因此我们需要将这些类别的像素值赋为 255,以表示它们不在训练集中,从而避免对模型的训练造成干扰。
相关问题
sentences = [x[0] for x in batch] labels = [x[1] for x in batch] # batch length batch_len = len(sentences) # 计算输入的最大长度(包含cls) max_len = max([len(s) for s in sentences]) # padding data 初始化 batch_data = self.word_pad_idx * np.ones((batch_len, max_len)) batch_label_starts = [] # padding sentence for j in range(batch_len): cur_len = len(sentences[j]) batch_data[j][:cur_len] = sentences[j] # padding label batch_labels = self.label_pad_idx * np.ones((batch_len, max_len-1)) # label长度比sent少cls for j in range(batch_len): cur_tags_len = len(labels[j]) batch_labels[j][:cur_tags_len] = labels[j] # convert data to torch LongTensors batch_data = torch.tensor(batch_data, dtype=torch.long) batch_labels = torch.tensor(batch_labels, dtype=torch.long) # shift tensors to GPU if available batch_data = batch_data.to(self.device) batch_labels = batch_labels.to(self.device) return [batch_data, batch_labels]
这段代码是上面提到的方法中的具体实现。首先,将batch中的句子和标签分别取出来,并计算出batch的长度和输入最大长度(包含cls)。然后,初始化一个填充后的数据batch_data,将每个句子进行padding,并将句子转化为torch LongTensors类型的数据。接着,对标签也进行padding,并将标签转化为torch LongTensors类型的数据。最后,将数据转移到GPU上(如果可用的话)并返回。总体来说,这段代码的作用是将数据进行填充和转化,以便于在模型中进行训练和预测。
代码import os import numpy as np import nibabel as nib from PIL import Image # 创建保存路径 save_path = 'C:/Users/Administrator/Desktop/2D-LiTS2017' if not os.path.exists(save_path): os.makedirs(save_path) if not os.path.exists(os.path.join(save_path, 'image')): os.makedirs(os.path.join(save_path, 'image')) if not os.path.exists(os.path.join(save_path, 'label')): os.makedirs(os.path.join(save_path, 'label')) # 加载数据集 data_path = 'D:/BaiduNetdiskDownload/LiTS2017' img_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 1') label_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 2') # 转换图像 for file in sorted(os.listdir(img_path)): if file.endswith('.nii'): img_file = os.path.join(img_path, file) img = nib.load(img_file).get_fdata() img = np.transpose(img, (2, 0, 1)) # 转换为z, x, y for i in range(img.shape[0]): img_slice = img[i, :, :] img_slice = (img_slice - np.min(img_slice)) / (np.max(img_slice) - np.min(img_slice)) * 255 # 归一化到0-255 img_slice = img_slice.astype(np.uint8) img_slice = np.stack([img_slice]*3, axis=2) # 转换为三通道图像 img_name = file[:-4] + '' + str(i).zfill(3) + '.png' img_file_save = os.path.join(save_path, 'image', img_name) Image.fromarray(img_slice).save(img_file_save) # 转换标签 for file in sorted(os.listdir(label_path)): if file.endswith('.nii'): label_file = os.path.join(label_path, file) label = nib.load(label_file).get_fdata() label = np.transpose(label, (2, 0, 1)) # 转换为z, x, y for i in range(label.shape[0]): label_slice = label[i, :, :] label_slice[label_slice == 1] = 255 # 肝脏灰度值设为255 label_slice[label_slice == 2] = 128 # 肝脏肿瘤灰度值设为128 label_slice = label_slice.astype(np.uint8) label_name = file[:-4] + '' + str(i).zfill(3) + '.png' label_file_save = os.path.join(save_path, 'label', label_name) Image.fromarray(label_slice).save(label_file_save)出现scaled = scaled.astype(np.promote_types(scaled.dtype, dtype), copy=False) MemoryError错误,怎么修改?给出完整代码
这个错误通常意味着你的计算机没有足够的内存来处理数组。可能需要减少转换图像的尺寸或者使用更高效的算法。以下是一个可能的修改建议:
```python
import os
import numpy as np
import nibabel as nib
from PIL import Image
# 创建保存路径
save_path = 'C:/Users/Administrator/Desktop/2D-LiTS2017'
if not os.path.exists(save_path):
os.makedirs(save_path)
if not os.path.exists(os.path.join(save_path, 'image')):
os.makedirs(os.path.join(save_path, 'image'))
if not os.path.exists(os.path.join(save_path, 'label')):
os.makedirs(os.path.join(save_path, 'label'))
# 加载数据集
data_path = 'D:/BaiduNetdiskDownload/LiTS2017'
img_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 1')
label_path = os.path.join(data_path, 'Training Batch 2')
# 转换图像
for file in sorted(os.listdir(img_path)):
if file.endswith('.nii'):
img_file = os.path.join(img_path, file)
img = nib.load(img_file).get_fdata()
img = np.transpose(img, (2, 0, 1)) # 转换为z, x, y
for i in range(img.shape[0]):
img_slice = img[i, :, :]
img_slice = (img_slice - np.min(img_slice)) / (np.max(img_slice) - np.min(img_slice)) * 255 # 归一化到0-255
img_slice = img_slice.astype(np.uint8)
img_slice = np.stack([img_slice]*3, axis=2) # 转换为三通道图像
#减少图像大小
img_slice = np.array(Image.fromarray(img_slice).resize((512, 512), resample=Image.BICUBIC))
img_name = file[:-4] + '' + str(i).zfill(3) + '.png'
img_file_save = os.path.join(save_path, 'image', img_name)
Image.fromarray(img_slice).save(img_file_save)
# 转换标签
for file in sorted(os.listdir(label_path)):
if file.endswith('.nii'):
label_file = os.path.join(label_path, file)
label = nib.load(label_file).get_fdata()
label = np.transpose(label, (2, 0, 1)) # 转换为z, x, y
for i in range(label.shape[0]):
label_slice = label[i, :, :]
label_slice[label_slice == 1] = 255 # 肝脏灰度值设为255
label_slice[label_slice == 2] = 128 # 肝脏肿瘤灰度值设为128
label_slice = label_slice.astype(np.uint8)
label_name = file[:-4] + '' + str(i).zfill(3) + '.png'
label_file_save = os.path.join(save_path, 'label', label_name)
Image.fromarray(label_slice).save(label_file_save)
```
这里我们使用了 `PIL.Image` 中的 `resize()` 函数来减少图像大小。`resample=Image.BICUBIC` 用于指定插值方法,这里使用了 Bicubic 插值。这个方法可以保留图像的细节,并且可以减少内存使用。你也可以尝试使用其他插值方法。
阅读全文