基于XGBoost,用REF交叉验证进行特征选择,请写出详细的R语言代码
时间: 2024-02-10 20:10:40 浏览: 96
R语言-多线程并行计算原理与操作步骤-方法笔记
好的,以下是基于XGBoost和REF交叉验证进行特征选择的R语言代码:
```{r}
# 导入必要的包
library(xgboost)
library(caret)
# 加载数据
data <- read.csv("data.csv", header = TRUE)
# 将响应变量和特征变量分开
response <- data[, "response"]
features <- data[, !names(data) %in% "response"]
# 创建xgb.DMatrix对象
data_matrix <- xgb.DMatrix(data = as.matrix(features), label = response)
# 设置REF交叉验证参数
control <- trainControl(method = "repeatedcv", number = 10, repeats = 3, selectionFunction = "oneSE")
# 使用xgb.importance()函数进行特征选择
xgb_model <- xgb.train(data = data_matrix, objective = "binary:logistic")
importance <- xgb.importance(model = xgb_model)
importance_matrix <- importance$Feature
# 保留重要性评分在平均分以上的特征
mean_importance <- mean(importance_matrix[, "Gain"])
selected_features <- rownames(importance_matrix[importance_matrix[, "Gain"] >= mean_importance,])
# 使用caret包中的train()函数进行建模
model <- train(x = features[, selected_features], y = response, method = "xgbTree", trControl = control)
# 输出最佳模型的变量重要性
varImp(model)
```
这段代码将会对 `data.csv` 文件中的数据进行建模,并输出最佳模型的变量重要性。在这个过程中,我们使用了XGBoost算法和REF交叉验证来进行特征选择。
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