请帮我写一个聚类(angens )算法实例,要求有案例描述跟源码

时间: 2024-02-17 12:03:58 浏览: 21
好的,以下是一个使用Agnes聚类算法的示例代码和案例描述: 案例描述: 假设我们有一个数据集,其中包含5个数据点,每个数据点有两个特征:x和y。我们的目标是将这些数据点聚类成两个簇。我们将使用Agnes聚类算法来实现这个目标。 源码实现: ```python import numpy as np class AgnesCluster: def __init__(self, k=2, linkage='single'): self.k = k self.linkage = linkage def fit(self, X): # Initialize clusters clusters = [] for i in range(X.shape[0]): clusters.append([i]) # Compute pairwise distances between clusters distances = np.zeros((X.shape[0], X.shape[0])) for i in range(X.shape[0]): for j in range(i+1, X.shape[0]): distances[i,j] = np.linalg.norm(X[i]-X[j]) distances[j,i] = distances[i,j] # Merge clusters until k clusters remain while len(clusters) > self.k: # Find closest pair of clusters min_distance = np.inf for i in range(len(clusters)): for j in range(i+1, len(clusters)): if self.linkage == 'single': distance = np.min(distances[clusters[i],clusters[j]]) elif self.linkage == 'complete': distance = np.max(distances[clusters[i],clusters[j]]) elif self.linkage == 'average': distance = np.mean(distances[clusters[i],clusters[j]]) else: raise ValueError('Invalid linkage type') if distance < min_distance: min_distance = distance merge_pair = (i,j) # Merge closest pair of clusters clusters[merge_pair[0]] += clusters[merge_pair[1]] del clusters[merge_pair[1]] self.labels_ = np.zeros(X.shape[0]) for i, cluster in enumerate(clusters): self.labels_[cluster] = i return self.labels_ ``` 在这个示例代码中,我们定义了一个AgnesCluster类,它包含两个参数:k和linkage。k表示最终要聚类的簇的数量,linkage表示要使用的链接方法(single、complete或average)。我们还定义了一个fit方法,该方法接受一个数据集X,并返回每个数据点的标签。 在fit方法中,我们首先初始化每个数据点所在的初始簇。然后,我们计算每对簇之间的距离,并使用指定的链接方法来合并距离最近的两个簇,直到只剩下k个簇为止。最后,我们为每个数据点分配一个标签,该标签与其所属的簇的索引相对应。 下面是一个使用AgnesCluster类的示例: ```python X = np.array([[1,1], [2,1], [1,2], [4,3], [5,4]]) clusterer = AgnesCluster(k=2, linkage='single') labels = clusterer.fit(X) print(labels) ``` 输出: ``` [0. 0. 0. 1. 1.] ``` 在这个示例中,我们使用上述AgnesCluster类来将数据集X聚类成两个簇。我们指定了链接方法为single,这意味着我们将使用单链接方法来计算簇之间的距离。最终,我们得到了每个数据点的标签,其中0表示第一个簇,1表示第二个簇。 希望这个示例能够帮助你理解Agnes聚类算法的实现方式。

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