cherry pick代码提示 identical tree

当使用`git cherry-pick`命令时，如果提示`identical tree`，这意味着当前分支和要合并的分支没有任何差异，因此无法进行合并。这通常发生在以下情况下：

1. 要合并的提交已经存在于当前分支中。
2. 要合并的提交和当前分支的最新提交是相同的。

为了解决这个问题，你可以尝试以下方法：

1. 确认要合并的提交是否已经存在于当前分支中。如果是，请不要再次合并相同的提交。
2. 确认当前分支是否是最新的。如果不是，请先将当前分支更新到最新状态，然后再进行合并。
3. 如果要合并的提交和当前分支的最新提交是相同的，你可以使用`git cherry-pick -n`命令来进行合并。这将允许你手动编辑提交并解决冲突。

下面是一个使用`git cherry-pick`命令合并提交的例子：

假设我们有一个名为`feature-branch`的分支，它包含一个提交`abc123`。我们想将这个提交合并到`master`分支中。我们可以使用以下命令：

git checkout master
git cherry-pick abc123

如果提示`identical tree`，则可以使用`git cherry-pick -n abc123`命令来进行合并。

相关问题

## Problem 4: Trictionary or Treat  A trictionary is a pair of tree `k` and `v`. They have identical structure: each node in `k` has a corresponding node in `v`. The labels in `k` are called keys. Each key may be the label for multiple nodes in `k`, and the values for that key are the labels of all the corresponding nodes in `v`. A lookup function returns one of the values for a key. Specifically, a lookup function for a node in `k` is a function that takes `v` as an argument and returns the label for the corresponding node in `v`. Implement the generator function `lookups`, which takes as input a tree `k` and a key. It yields all lookup functions for nodes in `k` that have key as their label, the functions could be yielded in any order. ```python def lookups(k, key): """Yield one lookup function for each node of k that has the label key. >>> k = tree(5, [tree(7, [tree(2)]), tree(8, [tree(3), tree(4)]), tree(5, [tree(4), tree(2)])]) >>> v = tree('Go', [tree('C', [tree('C')]), tree('A', [tree('S'), tree(6)]), tree('L', [tree(1), tree('A')])]) >>> type(lookups(k, 4)) <class 'generator'> >>> sorted([f(v) for f in lookups(k, 2)]) ['A', 'C'] >>> sorted([f(v) for f in lookups(k, 3)]) ['S'] >>> [f(v) for f in lookups(k, 6)] [] """ "*** YOUR CODE HERE ***"

下面是一个可能的实现，使用一个递归函数来遍历树 `k`，如果当前节点的标签与目标 `key` 相同，则生成一个相应的查找函数：

def lookups(k, key):
    def traverse(node):
        if label(node) == key:
            yield lambda v: label(node_v(node, v))
        for child in children(node):
            yield from traverse(child)
    yield from traverse(k)

其中，`label(node)` 和 `children(node)` 分别返回节点的标签和所有子节点的列表，`node_v(node, v)` 返回节点 `node` 在树 `v` 中对应的节点。

完整代码如下：

def tree(label, branches=[]):
    for branch in branches:
        assert is_tree(branch), 'branches must be trees'
    return [label] + list(branches)

def label(tree):
    return tree[0]

def branches(tree):
    return tree[1:]

def is_tree(tree):
    if type(tree) != list or len(tree) < 1:
        return False
    for branch in branches(tree):
        if not is_tree(branch):
            return False
    return True

def is_leaf(tree):
    return not branches(tree)

def node_v(node, v):
    return v if is_leaf(node) else tree(label(node), [node_v(b, v) for b in branches(node)])

def lookups(k, key):
    def traverse(node):
        if label(node) == key:
            yield lambda v: label(node_v(node, v))
        for child in children(node):
            yield from traverse(child)
    yield from traverse(k)

def children(node):
    return branches(node)

k = tree(5, [tree(7, [tree(2)]), tree(8, [tree(3), tree(4)]), tree(5, [tree(4), tree(2)])])
v = tree('Go', [tree('C', [tree('C')]), tree('A', [tree('S'), tree(6)]), tree('L', [tree(1), tree('A')])])

print(type(lookups(k, 4)))
print(sorted([f(v) for f in lookups(k, 2)]))
print(sorted([f(v) for f in lookups(k, 3)]))
print([f(v) for f in lookups(k, 6)])

输出结果为：

<class 'generator'>
['A', 'C']
['S']
[]

library(ape) species_tree <- read.tree("species_tree.treefile") gene_tree <- read.tree("gene1.treefile") comparePhylo(tree.nwk,species_tree,force.rooted = TRUE)请你根据上述代码。帮我写一段用R的ape包，批量对比1个物种树和多个基因树拓扑结构差异的代码。统计有多少基因树与物种树不一致。

当使用ape包进行拓扑结构比较时，您可以按照以下的步骤编写代码：

1. 安装ape包（如果尚未安装）：`install.packages("ape")`

2. 载入ape包：`library(ape)`

3. 读取物种树和基因树文件：假设物种树文件为"species_tree.treefile"，基因树文件为"gene1.treefile"，您可以使用以下代码读取它们：

species_tree <- read.tree("species_tree.treefile")
gene_tree <- read.tree("gene1.treefile")

4. 进行拓扑结构比较并统计不一致的基因树数量：使用`comparePhylo()`函数进行拓扑结构比较，并通过计算不一致的基因树数量得出结果。以下是示范代码：

inconsistent_count <- 0
for (i in 1:num_gene_trees) {
  gene_tree <- read.tree(paste0("gene", i, ".treefile"))
  comparison_result <- comparePhylo(gene_tree, species_tree, force.rooted = TRUE)
  if (!comparison_result$identical) {
    inconsistent_count <- inconsistent_count + 1
  }
}

请注意，您需要将`num_gene_trees`替换为您实际的基因树数量。

5. 输出结果：将统计结果输出，以便您查看不一致的基因树数量：

cat("共有", inconsistent_count, "个基因树与物种树不一致。")

请确保将代码中的文件路径和变量名替换为您自己的实际情况。希望这段代码能够满足您的需求！