将多个ROI的nii文件合并成一个nii文件

您可以使用Python的nibabel库来实现将多个ROI的nii文件合并成一个nii文件的操作。以下是一个示例代码：

import nibabel as nib
import numpy as np

# 读取多个ROI的nii文件
roi_files = ['ROI1.nii', 'ROI2.nii', 'ROI3.nii']
roi_data = [nib.load(file).get_fdata() for file in roi_files]

# 取第一个ROI的头文件信息作为合并后nii文件的头文件信息
merged_hdr = nib.load(roi_files[0]).header

# 合并ROI数据
merged_data = np.stack(roi_data, axis=-1)

# 创建合并后的nii文件
merged_img = nib.Nifti1Image(merged_data, None, header=merged_hdr)

# 保存合并后的nii文件
nib.save(merged_img, 'merged_roi.nii')

在上述代码中，首先使用`nib.load`方法读取多个ROI的nii文件，并使用`get_fdata`方法获取其数据。然后，通过取第一个ROI的头文件信息作为合并后nii文件的头文件信息。接下来，使用`np.stack`方法将ROI数据沿最后一个维度进行堆叠，得到合并后的数据。最后，使用`nib.Nifti1Image`创建合并后的nii文件，并使用`nib.save`保存合并后的nii文件。

注意：在实际操作中，请根据您的具体需求修改文件名、路径等相关参数。同时，确保多个ROI的nii文件的维度和头文件信息一致，以保证合并操作的正确性。