使用python 批量将nii文件转化成dcm文件

在Python中，可以使用Nipype库来批量地将NIFTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) 格式的脑部扫描图像转换为DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) 格式。下面是一个简化版的示例，展示了如何编写一个函数来遍历指定目录下的所有NIFTI文件，并使用Nipype的`CopyFile`节点来进行转换：

import os
from nipype.interfaces import io as nio

def batch_convert_nifti_to_dcm(input_folder, output_folder):
    # 初始化CopyFile接口
    copy_nii = nio.CopyFile()

    # 设置输出文件名格式
    def get_output_filename(filename):
        return os.path.splitext(filename)[0] + ".dcm"

    # 遍历输入文件夹
    for filename in os.listdir(input_folder):
        if filename.endswith(".nii") or filename.endswith(".nii.gz"):
            # 构建输入和输出文件路径
            input_file_path = os.path.join(input_folder, filename)
            output_file_path = os.path.join(output_folder, get_output_filename(filename))

            # 将NIFTI文件转换为DICOM
            copy_nii.inputs.in_file = input_file_path
            copy_nii.inputs.out_file = output_file_path
            copy_nii.run()  # 执行转换

    print(f"所有NIFTI文件已转换为DICOM并保存在{output_folder}.")

# 调用函数，传入输入和输出目录
input_folder = "path/to/input/nii_files"
output_folder = "path/to/output/dicom_files"
batch_convert_nifti_to_dcm(input_folder, output_folder)

这个脚本会递归检查输入文件夹及其子目录中的NIFTI文件，对每个找到的文件执行转换，并把结果保存到指定的输出目录下。