如何批量把nii转成dcm

将.nii (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) 格式的数据转换为.dcm (Digital Imaging and Communications in Medicine) 格式通常涉及到医学图像处理软件，例如FSL (Fiji的ImageJ插件)、ANTs (Advanced Normalization Tools) 或者直接使用专门的工具如NiBabel和Pydicom等Python库。

以下是使用Python和NiBabel库的一个简单示例步骤：

1. 安装必要的库：

pip install nibabel pydicom

2. 导入需要的模块：

import nibabel as nib
from pydicom import dcmread, dcmwrite
import os

3. 找到.nii文件所在的目录：

input_dir = '/path/to/nii/files'
output_dir = '/path/to/dcm/files'

4. 遍历.nii文件并转换：

for filename in os.listdir(input_dir):
    if filename.endswith(".nii") or filename.endswith(".nii.gz"):
        # 使用Nibabel加载.nii文件
        img_nii = nib.load(os.path.join(input_dir, filename))

        # 获取数据和元数据
        data = img_nii.get_fdata()
        header = img_nii.header

        # 创建一个新的DicomFile对象
        dicom_file = dcmread(data, force=True)

        # 设置dicom的元数据
        dicom_file.header.set_slope_inter(img_nii.header.get_slope_inter())
        dicom_file.file_meta.TransferSyntaxUID = img_nii.header.get_best_affine().encoding

        # 将数据保存为.dcm
        output_filename = os.path.splitext(filename)[0] + ".dcm"
        dcmwrite(os.path.join(output_dir, output_filename), dicom_file)

5. 转换完成后，`output_dir`里就包含了对应的.dcm文件。