在4.1.3版本的R语言中建立ergm模型,参照分布项设置为泊松分布,引入关键的包,对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,绘制后验密度图、迭代轨迹图、自相关图像

时间: 2024-02-03 20:15:20 浏览: 26
首先,需要安装并加载ergm包和MCMC包。然后,读入数据并建立ergm模型,设置分布项为泊松分布。 ```R library(ergm) library(MCMC) data <- read.table("data.txt") model <- ergm(data ~ edges + mutual + gwdegree(0.5, fixed = TRUE), response = "cnt", distribution = "poisson") ``` 接下来,使用MH采样函数进行参数估计,并绘制后验密度图、迭代轨迹图、自相关图像。 ```R MHout <- MHmcmc(model, control = list(iterations = 1000, burnin = 500, thin = 2)) # 绘制后验密度图 plot(density(MHout$coef["edges", ]), main = "Posterior Density of Edges", xlab = "Edges", ylab = "Density", col = "blue") # 绘制迭代轨迹图 plot(MHout$coef["edges", ], type = "l", main = "Iteration Trajectory of Edges", xlab = "Iterations", ylab = "Edges", col = "blue") # 绘制自相关图像 acf(MHout$coef["edges", ], main = "Autocorrelation of Edges", lag.max = 20) ``` 然后,使用Gibbs采样函数进行参数估计,并绘制后验密度图、迭代轨迹图、自相关图像。 ```R Gibbsout <- Gibbsmcmc(model, control = list(iterations = 1000, burnin = 500, thin = 2)) # 绘制后验密度图 plot(density(Gibbsout$coef["edges", ]), main = "Posterior Density of Edges", xlab = "Edges", ylab = "Density", col = "red") # 绘制迭代轨迹图 plot(Gibbsout$coef["edges", ], type = "l", main = "Iteration Trajectory of Edges", xlab = "Iterations", ylab = "Edges", col = "red") # 绘制自相关图像 acf(Gibbsout$coef["edges", ], main = "Autocorrelation of Edges", lag.max = 20) ``` 最后,可以将MH采样函数和Gibbs采样函数的结果进行比较,并进行模型诊断和评估。

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