在4.1.3版本的R语言中建立ergm模型,参照分布项设置为泊松分布,引入关键的包,对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,并绘制后验密度、迭代轨迹、自相关图像
时间: 2024-02-03 10:15:06 浏览: 104
Python库 | checkdmarc-4.1.3.tar.gz
首先,我们需要安装并引入ERGM和ergm.counts包:
```r
install.packages("ergm")
install.packages("ergm.counts")
library(ergm)
library(ergm.counts)
```
然后,我们可以使用ergm.counts包中的`ergm_counts`函数来建立ERGM模型,并设置分布项为泊松分布:
```r
data(faux.mesa.high)
model <- ergm_counts(edges ~ edges + mutual + istar(2) + ostar(2), ~edges,
response=faux.mesa.high$y, offset=faux.mesa.high$offsets,
dist="poisson")
```
接下来,我们可以使用MH算法进行参数估计:
```r
set.seed(123)
summary(MHmcmc(model, 1000))
```
也可以使用Gibbs采样函数进行参数估计:
```r
set.seed(123)
summary(Gibbsmcmc(model, 1000))
```
在绘制后验密度、迭代轨迹、自相关图像时,我们可以使用ergm包中的`plot`函数:
```r
plot(MHmcmc(model, 1000))
plot(Gibbsmcmc(model, 1000))
```
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