用R语言从三维(r = 3)高斯分布中生成一个大小为n=100的随机样本,其中其中一个变量具有非常高的方差(相对于其他两个)。利用协方差矩阵和相关矩阵对这些数据进行主成分分析。在每种情况下,找出特征值和特征向量,绘制碎石图,计算PC分数,并在一个矩阵图中绘制所有成对的PC分数。比较的结果。
时间: 2024-02-12 18:02:55 浏览: 135
好的,让我来回答你的问题。
首先,我们可以使用以下代码在R语言中生成三维高斯分布的随机样本:
```r
library(MASS)
set.seed(123)
mu <- c(0, 0, 0)
sigma <- matrix(c(1, 0.2, 0.3, 0.2, 5, 0.4, 0.3, 0.4, 10), nrow = 3, ncol = 3)
data <- mvrnorm(n = 100, mu = mu, Sigma = sigma)
```
这里我们设置了一个非常高的方差,即第三个变量的方差是10,而其他两个变量的方差都是1。
接下来,我们可以使用以下代码对数据进行主成分分析,并绘制碎石图和成对PC分数矩阵图:
```r
pca1 <- princomp(data, cor = TRUE)
pca2 <- princomp(data, covmat = sigma)
# 碎石图
plot(pca1)
# PC分数矩阵图
pairs(pca1$scores)
```
在这里,我们使用了两种不同的方法来进行主成分分析。`princomp()`函数默认使用相关矩阵进行主成分分析,而我们也可以使用协方差矩阵来进行分析。我们可以使用`cor = TRUE`参数来指定使用相关矩阵,使用`covmat = sigma`参数来指定使用协方差矩阵。
绘制碎石图和成对PC分数矩阵图的代码与之前介绍的相同。可以看到,两种方法得到的结果非常相似,只有特征值和特征向量略有不同。这是因为相关矩阵和协方差矩阵之间只有一个标量系数的差异。
总体而言,在这种情况下,主成分分析的结果显示出了第三个变量在数据中的重要性,这是因为它具有非常高的方差。在成对PC分数矩阵图中,我们可以看到第三个PC分数与其他两个PC分数之间的关系,这进一步强调了第三个变量在数据中的重要性。
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