用bsub -n 执行makefile
时间: 2024-02-19 17:03:31 浏览: 197
如果您想使用bsub命令在集群中执行makefile文件,可以使用以下命令:
```
bsub -n [核心数] "make"
```
其中,[核心数]是您想要在集群上使用的核心数。此命令将提交一个作业,该作业将在集群上运行makefile文件。请注意,在使用bsub命令提交作业之前,您需要先登录到集群系统上。
如果您想在bsub命令中指定makefile文件的路径,可以使用以下命令:
```
bsub -n [核心数] "make -f [makefile路径]"
```
其中,[makefile路径]是您的makefile文件的完整路径。
相关问题
sed -i 's/bsub.*make/bsub -n 40 -m $1 -I -q $2 -J $3 make covsim/' sim_rerun翻译成python
`sed -i 's/bsub.*make/bsub -n 40 -m $1 -I -q $2 -J $3 make covsim/' sim_rerun` 是一个 shell 脚本中的命令,表示使用 `sed` 工具将 `sim_rerun` 文件中的字符串 `bsub.*make` 替换为 `bsub -n 40 -m $1 -I -q $2 -J $3 make covsim`,并将替换后的内容保存回 `sim_rerun` 文件中。在 Python 中,可以使用 `re` 模块中的 `sub()` 函数进行替换操作,例如:
```python
import re
# 读取文件内容
with open("sim_rerun", "r") as f:
content = f.read()
# 替换字符串
new_content = re.sub(r"bsub.*make", r"bsub -n 40 -m $1 -I -q $2 -J $3 make covsim", content)
# 保存替换后的内容到文件中
with open("sim_rerun", "w") as f:
f.write(new_content)
```
在上面的示例中,首先使用 `open()` 函数读取名为 `sim_rerun` 的文件的内容,并使用 `re.sub()` 函数将匹配到的字符串进行替换操作,其中第一个参数 `r"bsub.*make"` 表示要匹配的正则表达式,第二个参数 `r"bsub -n 40 -m $1 -I -q $2 -J $3 make covsim"` 表示要替换成的字符串。需要注意的是,在正则表达式中使用了 `.*` 表示匹配任意字符,而在替换的字符串中使用了 `$1`、`$2` 和 `$3` 表示要替换的变量。最后,使用 `open()` 函数将替换后的内容保存回名为 `sim_rerun` 的文件中。
bsub -b -I -q q_sw_cpc2023 -shared -n 1 -cgsp 64 -host_stack 1024 -share_size 15000 ./pcg_solve
这是一个使用 LSF(Load Sharing Facility)系统提交作业的命令,其中各个参数的含义如下:
- `-b` 表示将作业提交到后台运行。
- `-I` 表示在作业运行期间保持标准输入开放。
- `-q q_sw_cpc2023` 表示将作业提交到名为 q_sw_cpc2023 的队列中。
- `-shared` 表示作业运行在共享模式下。
- `-n 1` 表示作业占用一个计算节点。
- `-cgsp 64` 表示将计算资源按照64个核心的比例分配给作业。
- `-host_stack 1024` 表示设置作业的堆栈大小为1024KB。
- `-share_size 15000` 表示设置作业运行所需的最大内存限制为15000MB。
- `./pcg_solve` 表示要运行的程序名称及其路径。
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