output = model(g, g.ndata['feat'])报错,TypeError: forward() takes 2 positional arguments but 3 were given
时间: 2023-11-07 15:08:52 浏览: 106
这个错误提示意味着你的 `forward` 方法只接受两个参数,但是在调用 `model` 的时候却传入了三个参数。根据你的代码,第一个参数 `g` 是图数据,第二个参数 `g.ndata['feat']` 是图节点的特征,但是似乎缺少一个参数。
如果你使用的是DGL库构建图神经网络,通常情况下在调用 `model` 的时候只需要传入一个参数 `g`,然后在 `forward` 方法里面通过 `ndata` 访问节点特征和边特征。所以你可能需要修改一下 `forward` 方法的定义,使其只接受一个参数,然后通过 `self` 访问需要的图数据。
例如,你可以将 `forward` 方法的定义改为如下形式:
```
def forward(self, g):
h = g.ndata['feat']
...
return h
```
这样就可以通过 `model(g)` 调用了。
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import dgl import numpy as np import torch import torch.nn as nn import dgl.function as fn # 生成10个节点和15条边的图 g = dgl.rand_graph(10, 15) # 为每个节点随机生成一个特征向量 feat = np.random.rand(10, 5) # 为每条边随机生成一个特征向量 e_feat = np.random.rand(15, 3) # 将特征向量添加到图中 g.ndata['feat'] = torch.from_numpy(feat) g.edata['e_feat'] =torch.from_numpy(e_feat) # 随机给每个节点分配一个标签 labels = np.random.randint(0, 3, size=(10,)) g.ndata['label'] = torch.from_numpy(labels) class GraphSAGE(nn.Module): def __init__(self, in_feats, h_feats, num_classes): super(GraphSAGE, self).__init__() self.conv1 = dgl.nn.SAGEConv(in_feats, h_feats, 'mean') self.conv2 = dgl.nn.SAGEConv(h_feats, num_classes, 'mean') def forward(self, g, in_feat): h = self.conv1(g, in_feat) h = torch.relu(h) h = self.conv2(g, h) g.ndata['h'] = h hg = dgl.mean_nodes(g, 'h') return hg # 定义超参数 in_feats = 5 h_feats = 10 num_classes = 3 lr = 0.01 num_epochs = 20 # 创建模型和优化器 model = GraphSAGE(in_feats, h_feats, num_classes) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 训练模型 for epoch in range(num_epochs): logits = model(g, g.ndata['feat']) labels = g.ndata['label'] loss = nn.CrossEntropyLoss()(logits, labels) optimizer.zero_grad() loss.backward() optimizer.step() print('Epoch %d | Loss: %.4f' % (epoch, loss.item())) # 预测 model.eval() with torch.no_grad(): logits = model(g, g.ndata['feat']) pred = logits.argmax(1) print('Predicted labels:', pred) 报错:RuntimeError: expected scalar type Double but found Float
这个错误是因为在创建特征向量时使用了numpy中的float64类型,而在将特征向量添加到图中时使用了torch中的float32类型。你可以在生成特征向量时将其转换为float32类型,如下所示:
```python
feat = np.random.rand(10, 5).astype(np.float32)
e_feat = np.random.rand(15, 3).astype(np.float32)
```
这样,在将特征向量添加到图中时,就可以直接使用它们了。
def forward(self, g, feat): with g.local_scope(): g.ndata['h'] = feat g.update_all(self.message_func1, fn.mean(msg='m', out='h')) # g.update_all(self.message_func2, fn.mean(msg='m', out='h')) node_rep = g.ndata['h'] if self.layer_norm: node_rep = self.layer_norm_weight(node_rep) if self.bias: node_rep = node_rep + self.h_bias if self.self_loop: h = self.node_ME(feat, feat) node_rep = node_rep + h if self.activation: node_rep = self.activation(node_rep) node_rep = self.dropout(node_rep) return node_rep
这段代码是 GNNLayer 中的 `forward` 方法的实现。
`` 方法用于执行 GNNLayer 的前向计算。首先,通过 `g.local_scope()` 创建一个本地作用域以确保计算的中结果不会影响其他计算。然后,将输入特征 `feat` 存储在图 `g` 的节点特征字典 `ndata` 中的键 `'h'` 下。
接下来,使用 `g.update_all(self.message_func1, fn.mean(msg='m', out='h'))` 对图 `g` 中的所有边进行消息传递,并使用 `mean` 函数对接收到的消息进行聚合,然后将结果存储在节点特征字典 `ndata` 的键 `'h'` 中。
随后,根据需要对节点特征进行一系列操作。如果 `layer_norm` 为真,则对节点特征进行层归一化操作。如果 `bias` 为真,则对节点特征添加偏置项。如果 `self_loop` 为真,则使用 `node_ME` 对输入特征进行记忆编码,并将结果与节点特征相加。接着,如果提供了激活函数,则对节点特征进行激活操作。最后,对节点特征进行 `dropout` 操作,并将结果返回。
这段代码展示了 GNNLayer 中前向计算的具体实现。在前向计算过程中,首先进行消息传递和聚合操作,然后根据需要对节点特征进行一系列的转换和操作,最终得到更新后的节点表示。这个方法用于更新图神经网络中每一层节点的表示,并将结果传递给下一层进行进一步的计算。
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