请帮我找一下在zinc中筛选好结构的代码
时间: 2024-05-12 10:18:47 浏览: 19
以下是一个简单的在ZINC中筛选好结构的Python代码示例:
```python
import requests
# 定义ZINC API的基本URL
ZINC_API_BASE_URL = 'https://zinc.docking.org/api/v1'
# 定义筛选条件
FILTER_CONDITIONS = {
'property': 'mw',
'min': 200,
'max': 500,
'condition': 'range'
}
# 定义其他参数
NUM_RESULTS = 100
OUTPUT_FORMAT = 'sdf'
# 构造API请求URL
url = f'{ZINC_API_BASE_URL}/search?result_format={OUTPUT_FORMAT}&count={NUM_RESULTS}&{FILTER_CONDITIONS}'
# 发送API请求并获取结果
response = requests.get(url)
# 处理结果
if response.status_code == 200:
# 成功获取结果,可以通过response.text获取结果的字符串形式
print(response.text)
else:
# 获取结果失败,可以通过response.status_code和response.text查看具体原因
print(f'Request failed with status code {response.status_code}: {response.text}')
```
说明:
- 首先定义ZINC API的基本URL为`https://zinc.docking.org/api/v1`。
- 然后定义了一个字典`FILTER_CONDITIONS`,其中包含了筛选条件,包括分子量(mw)在200到500之间。
- 然后定义了其他请求参数,包括要返回的结果数量(NUM_RESULTS)和输出格式(OUTPUT_FORMAT)。
- 构造API请求URL,包括基本URL、结果格式、数量和筛选条件。
- 发送API请求并获取结果,如果请求成功则会返回状态码200和结果字符串,否则返回失败原因。
- 对于获取成功的结果,可以对其进行解析和处理,例如使用RDKit进行分子结构的可视化等。
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