python写一段KPCA根据方差贡献率确定降维数的代码
时间: 2023-07-10 21:29:03 浏览: 193
好的,以下是一个简单的KPCA降维代码示例,其中包含根据方差贡献率确定降维数的部分:
```python
import numpy as np
from sklearn.decomposition import KernelPCA
# 加载数据集
X = np.loadtxt('data.txt')
# 计算KPCA主成分
kpca = KernelPCA(kernel='rbf')
kpca.fit(X)
# 计算方差贡献率并排序
variance_ratio = kpca.explained_variance_ratio_
idx = np.argsort(variance_ratio)[::-1]
variance_ratio = variance_ratio[idx]
# 累计方差贡献率
cumulative_variance_ratio = np.cumsum(variance_ratio)
# 根据方差贡献率阈值确定降维数
threshold = 0.95
n_components = np.argmax(cumulative_variance_ratio >= threshold) + 1
# 降维
kpca = KernelPCA(kernel='rbf', n_components=n_components)
X_new = kpca.fit_transform(X)
```
在这个示例代码中,我们首先使用sklearn库中的KernelPCA类来计算KPCA主成分。然后,我们计算每个主成分的方差贡献率,并按照贡献率从大到小排序。接下来,我们计算累计方差贡献率,并根据方差贡献率阈值确定降维数。最后,我们使用KernelPCA类进行数据降维,并得到降维后的新数据集X_new。
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