python中KernelPCA怎么根据方差贡献率之和设置主成分个数
时间: 2024-03-21 15:43:49 浏览: 154
在python中,使用KernelPCA进行降维时,可以通过设置参数n_components来指定要保留的主成分个数,也可以通过设置参数explained_variance_ratio_来根据方差贡献率之和来自动选择主成分个数。具体步骤如下:
1. 导入KernelPCA模块。
```python
from sklearn.decomposition import KernelPCA
```
2. 定义KernelPCA模型,设置参数kernel为核函数类型,例如'rbf'表示使用高斯核函数,设置参数n_components为None,表示不指定主成分个数。
```python
kpca = KernelPCA(kernel='rbf', n_components=None)
```
3. 使用fit_transform方法对数据进行降维,并计算出每个主成分的方差贡献率。
```python
X_kpca = kpca.fit_transform(X)
explained_variance_ratio_ = kpca.explained_variance_ratio_
```
4. 根据方差贡献率之和自动选择主成分个数,例如设置预设的方差贡献率之和为0.95。
```python
threshold = 0.95
n_components = np.sum(np.cumsum(explained_variance_ratio_) < threshold) + 1
```
5. 重新定义KernelPCA模型,设置参数n_components为自动选择的主成分个数。
```python
kpca = KernelPCA(kernel='rbf', n_components=n_components)
```
6. 使用fit_transform方法对数据进行降维,得到降维后的数据。
```python
X_kpca = kpca.fit_transform(X)
```
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