python读取.cex文件
时间: 2023-10-26 08:18:26 浏览: 45
要读取.cex文件,可以使用Python中的第三方库chemfp。首先需要安装chemfp库:
```
pip install chemfp
```
然后,可以使用以下代码读取.cex文件:
```python
from chemfp import CexReader
# 打开.cex文件
with open("file.cex", "rb") as f:
# 创建CexReader对象
reader = CexReader(f)
# 读取所有记录
for record in reader:
print(record)
```
上述代码将会打印出.cex文件中的所有记录。你可以根据自己的需求,对记录进行处理和分析。
相关问题
python读取cex文件
要读取cex文件,可以使用Python中的第三方库pycex和pandas。
首先需要安装这两个库,可以通过pip命令来安装:
```
pip install pycex
pip install pandas
```
然后可以使用以下代码来读取cex文件:
```python
import pandas as pd
from pycex import CexReader
# 读取cex文件
cex = CexReader('path/to/cex_file.cex').read()
# 转换为pandas的DataFrame格式
df = pd.DataFrame(cex)
# 输出DataFrame
print(df)
```
上述代码中,我们首先使用pycex库的CexReader类来读取cex文件,然后将其转换为pandas的DataFrame格式。最后输出DataFrame即可。
In corrplot(data_cor) : Not been able to calculate text margin, please try again with a clean new empty window using {plot.new(); dev.off()} or reduce tl.cex
您好!对于这个警告信息,它是由R中的corrplot包产生的。它表明在绘制相关性矩阵图时,无法计算文本边距。这可能是由于绘图设备的大小不足以容纳所有的文本信息引起的。
为了解决这个问题,您可以尝试以下几种方法:
1. 清空并关闭所有的绘图设备:可以使用以下命令清空并关闭所有的绘图设备:
```R
plot.new()
dev.off()
```
这将关闭所有的绘图窗口,并重新开始一个新的空白窗口。
2. 减小文本的大小:您可以尝试通过减小相关性矩阵图中文本的大小来解决问题。可以使用`tl.cex`参数来控制文本的大小,将其设置为一个较小的值,例如0.8或更小:
```R
corrplot(data_cor, tl.cex = 0.8)
```
这样可以减小文本的大小,从而使得在较小的绘图设备上能够容纳更多的文本信息。
希望这些方法能够帮助您解决问题!如果您有任何其他问题,请随时提问。