p2 <-p + coord_flip() + labs(x = "Feature", # 替换为你想要的标题 y = "SHAP value (impact on model output)")同时修改自动生成的右侧图例标题

时间: 2024-12-16 20:16:38 浏览: 8
这段代码是在R语言中使用ggplot2包对数据框(p或p2)进行操作,进行了坐标轴翻转(`coord_flip()`),并将X轴标题改为"特征",Y轴标题改为"SHAP值(对模型输出的影响)"。同时,它也改变了默认图例的位置,并可能会自动创建右侧图例。如果要修改右侧图例标题,你需要明确指定`theme`或`labs`中的`guide_legend`部分。 假设你想将右侧图例标题也改为"SHAP值解释",你可以这样做: ```r p2 <- p + coord_flip() + labs(x = "特征", y = "SHAP value (impact on model output)") + theme( legend.position = "top", # 或者选择其他位置如"right"或"none" guide_legend = guide_legend(title = "SHAP值解释") ) # 如果原图已经有一个默认的右侧图例,上述代码会覆盖它 ``` 这里使用了`guide_legend(title = "SHAP值解释")`来定制右侧图例标题。如果你想要保持原图例的其他设置不变,只需指定`title`属性即可。
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# 创建金字塔图 > ggplot(summary_data, aes(x = reorder(WklyStudyHours, ifelse(Gender == "female", AvgTotalScore, -AvgTotalScore)), y = AvgTotalScore)) + + geom_bar(stat = "identity", aes(fill = Gender), width = 0.5) + + scale_fill_manual(values = c("pink", "blue")) + + theme_bw() + + labs(x = "WklyStudyHours", y = "AvgTotalScore") + + coord_flip() + + geom_segment(aes(x = 0, xend = 0, y = min(summary_data$AvgTotalScore), yend = max(summary_data$AvgTotalScore)), color = "black", linetype = "dashed") + + scale_x_continuous(breaks = c(-300, 0, 300), labels = abs(c(-300, 0, 300))) Error: Discrete value supplied to continuous scale

这个错误提示意味着您在使用 `scale_x_continuous()` 函数时,将离散值传递给了连续的比例尺。您需要检查您传递给 `scale_x_continuous()` 函数的参数,确保这些参数是连续的值。可能原因是您传递给 `scale_x_continuous()` 函数的 `breaks` 参数中包含了离散值。您可以修改这些离散值为连续的值,或者将 `scale_x_discrete()` 函数替换为 `scale_x_continuous()` 函数。如果您需要更多帮助,请提供更多关于您的数据和代码的上下文。

coef <- coef(fit) nz_idx <- which(coef != 0) nz_snps <- nz_idx - 1 df <- data.frame(lambda = rep(lam, length(coef)), coef = coef, SNP = row.names(coef)) ggplot(df, aes(x = SNP, y = coef, fill = abs(coef) > 0.1)) + geom_col() + scale_fill_manual(values = c("lightgray", "red")) + geom_hline(yintercept = 0, linetype = "dashed", color = "black") + geom_vline(xintercept = which(df$lambda == lam), linetype = "dashed", color = "black") + coord_flip() + labs(x = "", y = "Coefficient", title = "Marginal Model") + theme_bw() + theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5), axis.text.x = element_text(angle = 90, vjust = 0.5, hjust = 1), legend.position = "none")

这段代码用于绘制岭回归模型中SNP的回归系数条形图。首先,使用`coef()`函数获取模型的回归系数,然后使用`which()`函数获取回归系数不为0的SNP的索引。接下来,将索引减1得到SNP的编号,然后创建一个数据框`df`,其中包括lambda、coef和SNP三列,分别表示岭回归的惩罚参数、回归系数和SNP编号。接着,使用`ggplot()`函数创建条形图,其中`x`表示SNP,`y`表示回归系数,`fill`表示系数的绝对值是否大于0.1。使用`scale_fill_manual()`函数设置填充颜色,使用`geom_hline()`函数添加水平虚线表示回归系数为0的位置,使用`geom_vline()`函数添加垂直虚线表示当前的惩罚参数lambda。最后,使用`coord_flip()`函数将x轴和y轴交换,使用`labs()`函数添加标题和标签,使用`theme_bw()`函数设置白色背景,使用`theme()`函数修改图形元素的样式。
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运行“library(ggplot2) # 创建示例数据 data <- data.frame( group = c(rep("A", 3), rep("B", 3), rep("C", 3)), subgroup = rep(LETTERS[1:3], 3), value = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9) ) # 计算每个子组的值的累计和 data$group_total <- ave(data$value, data$group, FUN = cumsum) data$subgroup_total <- ave(data$value, data$subgroup, FUN = cumsum) # 计算每个组的总和 group_total <- data.frame( group = unique(data$group), value = ave(data$value, data$group, FUN = sum) ) # 计算每个子组在其所属组内的占比 data$subgroup_prop <- data$value / data$group_total # 计算每个组内每个子组的占比 data$subgroup_prop <- ave(data$subgroup_prop, data$group, data$subgroup, FUN = sum) # 计算每个组的占比 group_prop <- group_total$value / sum(data$value) # 绘制多层圆环图 ggplot(data, aes(x = "", y = subgroup_prop, fill = subgroup)) + geom_bar(width = 1, stat = "identity") + coord_polar(theta = "y") + scale_fill_hue() + theme_void() + theme(legend.position = "right") + ggtitle("Subgroup Proportions") + annotate("text", x = 1.5, y = 0, label = paste0(round(group_prop * 100, 2), "%"), size = 10) + geom_bar(data = group_total, aes(x = "", y = value, fill = group), width = 1, stat = "identity") + coord_polar(theta = "y", start = group_prop * 2 * pi) + scale_fill_hue() + ggtitle("Group Totals")”出现了“Coordinate system already present. Adding new coordinate system, which will replace the existing one. Scale for fill is already present. Adding another scale for fill, which will replace the existing scale. Error in geom_bar(): ! Problem while converting geom to grob. i Error occurred in the 1st layer. Caused by error in data_frame(): ! Can't recycle x1 (size 8) to match y1 (size 4). Run rlang::last_error() to see where the error occurred. Warning message: In x + coord$start : longer object length is not a multiple of shorter object length”

geodetic_to_gauss_trans(double lon, double lat, int zone_mode, double custom_longitude) { if ((lon >= -180 && lon <= 180) && (lat >= -90 && lat <= 90) && (zone_mode == -1 || zone_mode == 0 || zone_mode == 1) && (custom_longitude >= -180 && custom_longitude <= 180)) { switch (zone_mode) { case 1: if (lon >= 1.5) { zone_ = int((lon + 1.5) / 3); central_meridian_ = zone_ * 3; } if (lon < 1.5) { zone_ = int((lon + 1.5) / 3) + 120; central_meridian_ = zone_ * 3 - 360; } break; case -1: if (lon >= 0) { zone_ = int(lon / 6) + 1; central_meridian_ = zone_ * 6 - 3; } if (lon < 0) { zone_ = int(lon / 6) + 60; central_meridian_ = (zone_ * 6 - 3) - 360; } break; case 0: central_meridian_ = custom_longitude; break; } } else { x_ = 0; y_ = 0; return false; } std::string proj_string = "+proj=tmerc +lat_0=0 +lon_0=central_meridian +k=1 +x_0=500000 +y_0=0 +ellps=GRS80 +units=m +no_defs +type=crs"; std::string to_replace = "central_meridian"; std::string replace_with = std::to_string(central_meridian_); size_t pos = proj_string.find(to_replace); proj_string.replace(pos, to_replace.length(), replace_with); PJ_CONTEXT *C = proj_context_create(); PJ *P = proj_create(C, proj_string.c_str()); PJ *G = proj_crs_get_geodetic_crs(C, P); PJ_AREA *A = nullptr; const char *const *options = nullptr; PJ *G2P = proj_create_crs_to_crs_from_pj(C, G, P, A, options); PJ_COORD c_in{}; c_in.lpzt.z = 0.0; c_in.lpzt.t = HUGE_VAL; c_in.lp.lam = lon; c_in.lp.phi = lat; PJ_COORD c_out = proj_trans(G2P, PJ_FWD, c_in); x_ = c_out.enu.n; y_ = c_out.enu.e; // PJ_COORD c_inv = proj_trans(G2P, PJ_DIRECTION::PJ_INV, c_out); std::cout.precision(20); std::cout << std::fixed; std::cout << x_ << "," << y_ << std::endl; std::cout << std::fixed << c_inv.lp.lam << "," << c_inv.lp.phi << std::endl; proj_destroy(P); proj_destroy(G); proj_destroy(G2P); proj_context_destroy(C); return true; }

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