p2 <-p + coord_flip() + labs(x = "Feature", # 替换为你想要的标题 y = "SHAP value (impact on model output)")同时修改自动生成的右侧图例标题
时间: 2024-12-16 20:16:38 浏览: 8
这段代码是在R语言中使用ggplot2包对数据框(p或p2)进行操作,进行了坐标轴翻转(`coord_flip()`),并将X轴标题改为"特征",Y轴标题改为"SHAP值(对模型输出的影响)"。同时,它也改变了默认图例的位置,并可能会自动创建右侧图例。如果要修改右侧图例标题,你需要明确指定`theme`或`labs`中的`guide_legend`部分。
假设你想将右侧图例标题也改为"SHAP值解释",你可以这样做:
```r
p2 <- p + coord_flip() +
labs(x = "特征",
y = "SHAP value (impact on model output)") +
theme(
legend.position = "top", # 或者选择其他位置如"right"或"none"
guide_legend = guide_legend(title = "SHAP值解释")
)
# 如果原图已经有一个默认的右侧图例,上述代码会覆盖它
```
这里使用了`guide_legend(title = "SHAP值解释")`来定制右侧图例标题。如果你想要保持原图例的其他设置不变,只需指定`title`属性即可。
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# 创建金字塔图 > ggplot(summary_data, aes(x = reorder(WklyStudyHours, ifelse(Gender == "female", AvgTotalScore, -AvgTotalScore)), y = AvgTotalScore)) + + geom_bar(stat = "identity", aes(fill = Gender), width = 0.5) + + scale_fill_manual(values = c("pink", "blue")) + + theme_bw() + + labs(x = "WklyStudyHours", y = "AvgTotalScore") + + coord_flip() + + geom_segment(aes(x = 0, xend = 0, y = min(summary_data$AvgTotalScore), yend = max(summary_data$AvgTotalScore)), color = "black", linetype = "dashed") + + scale_x_continuous(breaks = c(-300, 0, 300), labels = abs(c(-300, 0, 300))) Error: Discrete value supplied to continuous scale
这个错误提示意味着您在使用 `scale_x_continuous()` 函数时,将离散值传递给了连续的比例尺。您需要检查您传递给 `scale_x_continuous()` 函数的参数,确保这些参数是连续的值。可能原因是您传递给 `scale_x_continuous()` 函数的 `breaks` 参数中包含了离散值。您可以修改这些离散值为连续的值,或者将 `scale_x_discrete()` 函数替换为 `scale_x_continuous()` 函数。如果您需要更多帮助,请提供更多关于您的数据和代码的上下文。
coef <- coef(fit) nz_idx <- which(coef != 0) nz_snps <- nz_idx - 1 df <- data.frame(lambda = rep(lam, length(coef)), coef = coef, SNP = row.names(coef)) ggplot(df, aes(x = SNP, y = coef, fill = abs(coef) > 0.1)) + geom_col() + scale_fill_manual(values = c("lightgray", "red")) + geom_hline(yintercept = 0, linetype = "dashed", color = "black") + geom_vline(xintercept = which(df$lambda == lam), linetype = "dashed", color = "black") + coord_flip() + labs(x = "", y = "Coefficient", title = "Marginal Model") + theme_bw() + theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5), axis.text.x = element_text(angle = 90, vjust = 0.5, hjust = 1), legend.position = "none")
这段代码用于绘制岭回归模型中SNP的回归系数条形图。首先,使用`coef()`函数获取模型的回归系数,然后使用`which()`函数获取回归系数不为0的SNP的索引。接下来,将索引减1得到SNP的编号,然后创建一个数据框`df`,其中包括lambda、coef和SNP三列,分别表示岭回归的惩罚参数、回归系数和SNP编号。接着,使用`ggplot()`函数创建条形图,其中`x`表示SNP,`y`表示回归系数,`fill`表示系数的绝对值是否大于0.1。使用`scale_fill_manual()`函数设置填充颜色,使用`geom_hline()`函数添加水平虚线表示回归系数为0的位置,使用`geom_vline()`函数添加垂直虚线表示当前的惩罚参数lambda。最后,使用`coord_flip()`函数将x轴和y轴交换,使用`labs()`函数添加标题和标签,使用`theme_bw()`函数设置白色背景,使用`theme()`函数修改图形元素的样式。
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