错误于continuous_scale(aesthetics, name = name, palette = pal_seq_gradient(low, : 参数没有用(midpoint = 5)

时间: 2024-09-25 13:18:27 浏览: 37
错误信息提到的是关于在一个图形绘制函数中的连续颜色映射设置(`continuous_scale`)的一些参数。`continuous_scale`通常用于ggplot2包中,当你想要为数据的某个 aesthetics(如x轴、y轴、颜色等)创建连续的颜色渐变时会用到。在这个上下文中: - `aesthetics`: 需要指定你要应用连续颜色的图表元素,例如`"fill"`或`"color"`。 - `name`: 可选参数,给颜色方案命名。 - `palette`: 颜色序列或者渐变函数,如`pal_seq_gradient`,表示你希望的颜色变化范围。 - `low` 和 `midpoint`: 分别指定了颜色渐变的起始点和中间点。`midpoint=5` 表示颜色从低值向5(默认值)偏移后再逐渐变化。 看起来你在调用这个函数时忘记提供`midpoint`参数,这可能导致函数认为中途没有特定的转折点,或者颜色不会在5这个数值处有一个明确的变化。修复这个问题只需将`midpoint = 5`包含在调用`continuous_scale`的参数列表中,如下所示: ```r scale_fill_continuous(name = "My Scale", palette = pal_seq_gradient(low, midpoint = 5)) ```
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错误于continuous_scale(aesthetics, name = name, palette = pal_seq_gradient(low, : 参数没有用(midpoint = 5)

错误信息似乎是在描述如何在某些数据可视化库(比如ggplot2或其他基于matplotlib的库)中调整连续数值范围的颜色映射。`continuous_scale`函数看起来是用来设置图形上某个aesthetic(美学属性,如颜色、大小等)的连续颜色梯度。参数解释如下: - `aesthetics`:指定你要应用连续色标的 aesthetics 属性,如 "color" 或 "size"。 - `name`:(可选) 范围颜色的标签名称。 - `palette`:(默认 `pal_seq_gradient`) 用于创建连续颜色序列的方法,例如渐变色。 - `low` 和 `midpoint`:(可选) 范围的开始值和中间点值。`midpoint` 指定颜色映射中的中点,即颜色的转折点,默认可能是缺失的。 - `midpoint = 5` 表示你想将颜色序列的转折点设置在5这个值。 如果在实际使用中看到 `midpoint = 5` 参数没有被用到,那可能是你在调用该函数的时候忘记添加了这个参数,或者这个参数在这个上下文中不是必需的。检查一下你的代码,确认是否需要设置这个中点值,因为如果没有明确指定,可能会按照默认规则进行颜色映射。如果你的意图是要将转折点设在5,那么应该像这样调用: ```R scale_color_continuous(name = "My Scale", palette = pal_seq_gradient(low, midpoint = 5)) ```

> bplot<-ggplot(data=data,aes(x=处理2, y=牧食量, fill= 处理3))+geom_bar(stat="identity",position="dodge")+geom_errorbar(aes(ymax=牧食量+se,ymin=牧食量-se),position=position_dodge(0.9), width=0.15)+scale_fill_brewer(palette = "Set1")+geom_text (aes(y=牧食量+se+0.2,label=t),position=position_dodge(0.9), size=3)+ylab("biomass (g)")+facet_grid('. ~ 处理2') > bplot Don't know how to automatically pick scale for object of type <function>. Defaulting to continuous. Error in `geom_text()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 3rd layer. Caused by error in `compute_aesthetics()`: ! Aesthetics are not valid data columns. ✖ The following aesthetics are invalid: ✖ `label = t` ℹ Did you mistype the name of a data column or forget to add `after_stat()`? Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这个错误信息表明,在使用ggplot2函数绘图时出现了错误。其中,首先出现了一个警告,表示ggplot2无法自动选择适当的比例尺,因为对象的类型是一个函数。紧接着出现了一个错误,表示在使用`geom_text()`函数时出现了问题。具体地,错误是由于计算美学时出现了问题,其中`label=t`这个美学无效,可能是由于数据列名错误或者忘记添加`after_stat()`函数。建议使用`rlang::last_trace()`函数查看错误发生的位置并进行排查。 以下是可能的代码修改: ``` bplot <- ggplot(data = data, aes(x = 处理2, y = 牧食量, fill = 处理3)) + geom_bar(stat = "identity", position = "dodge") + geom_errorbar(aes(ymax = 牧食量 + se, ymin = 牧食量 - se), position = position_dodge(0.9), width = 0.15) + scale_fill_brewer(palette = "Set1") + geom_text(aes(y = 牧食量 + se + 0.2, label = "t"), position = position_dodge(0.9), size = 3, after_stat = TRUE) + ylab("biomass (g)") + facet_grid('. ~ 处理2') bplot ``` 在修改后的代码中,美学映射`label`被修改为字符串`"t"`,因为`label`需要指向数据中某个列的名称,而不是直接使用变量名。同时,添加了`after_stat = TRUE`参数来指示在数据计算之后使用标签,而不是在计算标签之前。 如果问题还未解决,建议使用`rlang::last_trace()`函数查看错误发生的位置并进行排查。

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> ggplot()+ + geom_histogram(binwidth = 200,data=data,aes(x=SII,y=..frequency..),alpha = 0.8,colour="gold3",fill="gold3")+ + scale_y_continuous(sec.axis = sec_axis(~.*4000, name = "HR (95%CI) for 2-year all-cause mortality"))+ + geom_line(data=HR, aes(SII,yhat/4000), + linetype="solid",size=1,alpha = 0.7,colour="steelblue1")+ + geom_ribbon(data=HR, + aes(SII,ymin = lower/4000, ymax = upper/4000), + alpha = 0.1,fill="blue")+ + theme_classic()+ + geom_hline(yintercept=1/4000, linetype=2,size=1)+ + geom_vline(xintercept=570,size=1,linetype=2,color = '#d40e8c')+ + geom_vline(xintercept=1000,size=1,linetype=2,color = '#d40e8c')+#查表HR=1对应的age + labs(x="Systemic immune-inflammation index", y="Density")+ + xlim(0,4000)+ + labs(title = " ")+ + theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) Error in geom_histogram(): ! Problem while mapping stat to aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in map_statistic(): ! Aesthetics must be valid computed stats. ✖ The following aesthetics are invalid: ✖ y = ..frequency.. ℹ Did you map your stat in the wrong layer? Run rlang::last_error() to see where the error occurred. Warning messages: 1: Using size aesthetic for lines was deprecated in ggplot2 3.4.0. ℹ Please use linewidth instead. This warning is displayed once every 8 hours. Call lifecycle::last_lifecycle_warnings() to see where this warning was generated. 2: The dot-dot notation (..frequency..) was deprecated in ggplot2 3.4.0. ℹ Please use after_stat(frequency) instead. This warning is displayed once every 8 hours. Call lifecycle::last_lifecycle_warnings() to see where this warning was generated. 3: Removed 70 rows containing non-finite values (stat_bin()).

Backtrace: ▆ 1. ├─cowplot::plot_grid(plotlist = plotlist, ncol = 1) 2. │ └─cowplot::align_plots(...) 3. │ └─base::lapply(...) 4. │ └─cowplot (local) FUN(X[[i]], ...) 5. │ ├─cowplot::as_gtable(x) 6. │ └─cowplot:::as_gtable.default(x) 7. │ ├─cowplot::as_grob(plot) 8. │ └─cowplot:::as_grob.ggplot(plot) 9. │ └─ggplot2::ggplotGrob(plot) 10. │ ├─ggplot2::ggplot_gtable(ggplot_build(x)) 11. │ │ └─ggplot2:::attach_plot_env(data$plot$plot_env) 12. │ │ └─base::options(ggplot2_plot_env = env) 13. │ ├─ggplot2::ggplot_build(x) 14. │ └─ggplot2:::ggplot_build.ggplot(x) 15. │ └─ggplot2:::by_layer(...) 16. │ ├─rlang::try_fetch(...) 17. │ │ ├─base::tryCatch(...) 18. │ │ │ └─base (local) tryCatchList(expr, classes, parentenv, handlers) 19. │ │ │ └─base (local) tryCatchOne(expr, names, parentenv, handlers[[1L]]) 20. │ │ │ └─base (local) doTryCatch(return(expr), name, parentenv, handler) 21. │ │ └─base::withCallingHandlers(...) 22. │ └─ggplot2 (local) f(l = layers[[i]], d = data[[i]]) 23. │ └─l$compute_aesthetics(d, plot) 24. │ └─ggplot2 (local) compute_aesthetics(..., self = self) 25. │ └─ggplot2:::scales_add_defaults(...) 26. │ └─base::lapply(aesthetics[new_aesthetics], eval_tidy, data = data) 27. │ └─rlang (local) FUN(X[[i]], ...) 28. └─base::.handleSimpleError(...) 29. └─rlang (local) h(simpleError(msg, call)) 30. └─handlers[[1L]](cnd) 31. └─cli::cli_abort(...) 32. └─rlang::abort(...)

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