[root@fdb46c5096dd picard-3.0.0]# java -jar picard.jar BuildBamIndex I=/var/www/html/sites/default/files/raw/pame.bam/pame.ont.bam O=/var/www/html/sites/default/files/raw/pame.bam/pame.ont.bam.bai Error: Unable to access jarfile picard.jar
时间: 2023-08-10 12:03:00 浏览: 49
这个错误通常是由于当前目录下没有找到`picard.jar`文件导致的。请确保您在运行Picard命令之前,已经正确导航到Picard工具的安装目录。
您可以按照以下步骤解决这个问题:
1. 确保您已经正确安装了Picard工具,并记住Picard工具的安装路径。
2. 打开终端或命令提示符,并使用`cd`命令导航到Picard工具的安装目录,例如:
```
cd /path/to/picard
```
在这个命令中,将`/path/to/picard`替换为实际的Picard工具安装路径。
3. 确认您已经在正确的目录中,可以使用`ls`命令查看当前目录下的文件列表,并确保`picard.jar`文件存在。
4. 使用带有完整路径的`java -jar`命令运行Picard的BuildBamIndex命令,例如:
```
java -jar /path/to/picard/picard.jar BuildBamIndex \
I=/var/www/html/sites/default/files/raw/pame.bam/pame.ont.bam \
O=/var/www/html/sites/default/files/raw/pame.bam/pame.ont.bam.bai
```
在这个命令中,将`/path/to/picard/picard.jar`替换为实际的`picard.jar`文件路径,并将输入和输出路径替换为您实际使用的路径。
确保按照上述步骤正确导航到Picard工具的安装目录,并提供正确的路径,以解决无法访问`picard.jar`文件的问题。