主成分分析 更改颜色 r语言
时间: 2023-09-25 22:11:27 浏览: 72
要更改主成分分析的图表颜色,可以使用 `ggfortify` 包中的 `autoplot` 函数。下面是一个简单的例子:
```r
library(ggfortify)
library(dplyr)
# 加载数据
data(iris)
# 对数据进行主成分分析
pca <- prcomp(select(iris, -Species), scale = TRUE)
# 绘制主成分分析图表并更改颜色
autoplot(pca, data = iris, colour = 'Species') +
scale_color_manual(values = c('red', 'blue', 'green'))
```
在这个例子中,我们首先加载 `ggfortify` 和 `dplyr` 包,并使用 `prcomp` 函数对鸢尾花数据集进行主成分分析。然后使用 `autoplot` 函数绘制主成分分析图表,并设置 `colour` 参数为 `Species`,以便按照鸢尾花的类型着色。最后,我们使用 `scale_color_manual` 函数更改颜色,将 `red` 分配给 `setosa` 类型,`blue` 分配给 `versicolor` 类型,`green` 分配给 `virginica` 类型。
这样,您就可以使用 `ggfortify` 包中的 `autoplot` 函数轻松地更改主成分分析图表的颜色。
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