凝聚层次聚类算法实现(非聚类库函数调用),要求算法输入:随机生成聚类的>=20个对象;算法输出:分类结果以及可视化的嵌套簇图,聚类过程中得到的最短距离值以及距离矩阵。

时间: 2023-07-06 19:40:03 浏览: 49
好的,我会尽力回答你的问题。首先,凝聚层次聚类算法是一种自下而上的聚类方法,它的基本思想是将初始时每个对象看作一个簇,然后将距离最近的两个簇合并成一个新的簇,重复此过程直到所有对象都被合并为止。在这个过程中,我们可以使用一个距离矩阵来保存每个对象之间的距离,然后通过不断地合并簇来更新距离矩阵,直到最终的聚类结果产生。 下面是一个简单的凝聚层次聚类算法的实现,用于随机生成聚类的>=20个对象: ```python import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt # 随机生成数据集 X = np.random.rand(20, 2) # 计算两两之间的距离 def dist(x, y): return np.sqrt(np.sum((x - y) ** 2)) D = np.zeros((20, 20)) for i in range(20): for j in range(i + 1, 20): D[i][j] = dist(X[i], X[j]) D[j][i] = D[i][j] # 层次聚类过程 def agglomerative(D): n = D.shape[0] clusters = [[i] for i in range(n)] while len(clusters) > 1: minDist, minI, minJ = float('inf'), -1, -1 for i in range(len(clusters)): for j in range(i + 1, len(clusters)): for m in clusters[i]: for n in clusters[j]: if D[m][n] < minDist: minDist, minI, minJ = D[m][n], i, j newCluster = clusters[minI] + clusters[minJ] clusters.pop(max(minI, minJ)) clusters.pop(min(minI, minJ)) clusters.append(newCluster) for i in range(n): if i not in newCluster: D[i][newCluster[0]] = min(D[i][clusters[minI][0]], D[i][clusters[minJ][0]]) D[newCluster[0]][i] = D[i][newCluster[0]] return clusters[0] # 可视化嵌套簇图 def plot_dendrogram(clusters, labels): n = len(clusters) height = np.zeros(2 * n - 1) height[:n] = [0.5] * n for i in range(n, 2 * n - 1): height[i] = (height[clusters[i - n][0]] + height[clusters[i - n][1]]) / 2 plt.figure(figsize=(10, 5)) plt.title('Dendrogram') plt.xlabel('Sample index') plt.ylabel('Distance') plt.plot(range(20), height[n - 1:], 'o-') plt.xticks(range(20), labels) plt.show() # 运行聚类算法并可视化结果 labels = ['x' + str(i + 1) for i in range(20)] clusters = agglomerative(D) plot_dendrogram(clusters, labels) print('最短距离值:', D[clusters[0][0]][clusters[0][1]]) print('距离矩阵:\n', D) ``` 运行上述代码后,你将会得到一个嵌套簇图,聚类结果以及距离矩阵。其中,嵌套簇图用于可视化聚类结果,聚类结果以列表形式返回,最短距离值表示最终合并的两个簇之间的距离,距离矩阵是一个二维数组,用于保存每个对象之间的距离。

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