已有配准生成的nii,gz全脑纤维文件,mrcalc提取已知编号为175的脑区生成单独文件
时间: 2023-08-19 08:08:35 浏览: 94
配准无颅骨的MR脑图像
可以使用 FSL 工具箱中的 `fslmaths` 命令和 `mrcalc` 命令来提取指定编号的脑区。
假设你的全脑纤维文件为 `full_brain_fiber.nii.gz`,编号为175的脑区为 `175_mask.nii.gz`,提取后的单独文件为 `175_fiber.nii.gz`,则可以按照以下步骤进行操作:
1. 使用 `fslmaths` 命令将全脑纤维文件和脑区文件相乘,得到编号为175的纤维部分:
```
fslmaths full_brain_fiber.nii.gz -mul 175_mask.nii.gz 175_fiber.nii.gz
```
2. 如果需要将编号为175的纤维部分与其他脑区相加,可以使用 `mrcalc` 命令。假设你已经提取了编号为200的纤维部分,文件名为 `200_fiber.nii.gz`,则可以按照以下命令进行操作:
```
mrcalc 175_fiber.nii.gz 200_fiber.nii.gz -add output_fiber.nii.gz
```
其中 `-add` 表示将两个文件相加,`output_fiber.nii.gz` 表示输出文件名。
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