opencv怎么保存dicom文件

时间: 2023-11-13 14:22:40 浏览: 58
要使用OpenCV保存DICOM文件,您需要将DICOM文件读入OpenCV中的Mat对象中,然后将其保存为图像文件。 以下是一些示例代码: ```python import cv2 import pydicom # 读取DICOM文件 ds = pydicom.dcmread("example.dcm") # 将DICOM转换为OpenCV Mat对象 img = ds.pixel_array.astype(float) / ds.pixel_array.max() img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2BGR) # 保存为图像文件 cv2.imwrite("example.jpg", img) ``` 这里,我们首先使用PyDicom库读取DICOM文件。然后,我们将像素数据转换为OpenCV Mat对象,并将其保存为JPEG文件。请注意,我们将像素数据除以最大值,以便将像素值归一化为0到1之间的浮点数。此外,我们将其转换为灰度图像,并将其转换为BGR格式以便保存为图像文件。
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opencv保存dicom文件

OpenCV不支持直接保存DICOM文件格式。DICOM是一种医学图像通信标准,它有着自己的数据格式和存储方式,与普通的图像文件格式不同。如果你需要保存DICOM文件,你需要使用专门的DICOM库。 在C++中,有许多DICOM库可以选择,比如: 1. GDCM:是一个开源的DICOM库,支持DICOM文件的读取和写入。 2. DCMTK:是一个功能强大的DICOM库,提供了许多DICOM相关的工具和应用程序。 3. ITK:是一个用于医学图像处理的开源库,支持多种医学图像格式,包括DICOM。 你可以使用其中的任何一个库来保存DICOM文件。需要注意的是,保存DICOM文件需要遵循DICOM标准,确保保存的文件与标准兼容。

c++ opencv 保存dicom

在C++中,您可以使用OpenCV和DCMTK库来读取和保存DICOM文件。下面是一个示例代码: ```c++ #include <iostream> #include <opencv2/core.hpp> #include <opencv2/highgui.hpp> #include <dcmtk/dcmdata/dctk.h> #include <dcmtk/dcmimgle/dcmimage.h> using namespace std; using namespace cv; int main() { // 读取DICOM文件 DcmFileFormat fileFormat; OFCondition status = fileFormat.loadFile("example.dcm"); if(status.bad()) { cerr << "Error: cannot read DICOM file (" << status.text() << ")" << endl; return 1; } // 获取图像数据 DicomImage* dcmImage = new DicomImage(fileFormat.getDataset(), fileFormat.getDataset()->getOriginalXfer()); if(dcmImage == NULL || dcmImage->getStatus() != EIS_Normal) { cerr << "Error: cannot load DICOM image (" << DicomImage::getString(dcmImage->getStatus()) << ")" << endl; return 1; } // 将图像转换为OpenCV Mat对象 Mat img(dcmImage->getHeight(), dcmImage->getWidth(), CV_16UC1, (uchar*)dcmImage->getOutputData(16 /* bits */)); // 保存为DICOM文件 cv::imwrite("example.jpg", img); DcmFileFormat outputFormat; outputFormat.getDataset()->putAndInsertString(DCM_SOPClassUID, UID_SecondaryCaptureImageStorage); outputFormat.getDataset()->putAndInsertString(DCM_SOPInstanceUID, "1.2.826.0.1.3680043.8.498.52121531541968868171723999453079438"); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_SamplesPerPixel, 1); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_PhotometricInterpretation, 1); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_Rows, img.rows); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_Columns, img.cols); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_BitsAllocated, 16); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_BitsStored, 16); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_HighBit, 15); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_PixelRepresentation, 0); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_SmallestImagePixelValue, 0); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16(DCM_LargestImagePixelValue, 65535); outputFormat.getDataset()->putAndInsertUint16Array(DCM_PixelData, (Uint16*)img.data, img.total()); // 保存为新的DICOM文件 status = outputFormat.saveFile("example.dcm"); if(status.bad()) { cerr << "Error: cannot save DICOM file (" << status.text() << ")" << endl; return 1; } return 0; } ``` 在这个示例代码中,我们首先使用DCMTK库读取DICOM文件,然后将其转换为OpenCV Mat对象。接下来,我们使用OpenCV将其保存为JPEG文件。最后,我们使用DCMTK库将其保存为新的DICOM文件。请注意,我们需要手动设置DICOM文件的一些元数据,如SOP Class UID、SOP Instance UID、Samples Per Pixel、Photometric Interpretation等。

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