ward聚类分析并可视化结果
时间: 2023-07-11 11:48:07 浏览: 181
首先,ward聚类是一种基于距离的聚类算法,它的核心思想是通过最小化聚类内平方和来确定最优分组。在Python中可以使用scikit-learn库中的ward算法实现。
以下是一个基于Iris数据集进行ward聚类分析的示例代码:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering
from sklearn.datasets import load_iris
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
iris = load_iris()
X = iris.data
# 使用Ward算法进行聚类
ward = AgglomerativeClustering(n_clusters=3, linkage='ward')
ward.fit(X)
# 绘制树状图
plt.figure(figsize=(15, 5))
plt.title('Hierarchical Clustering Dendrogram')
plt.xlabel('Sample Index')
plt.ylabel('Distance')
dendrogram(ward.distance_matrix_)
plt.show()
# 绘制聚类结果
plt.figure(figsize=(10, 7))
plt.scatter(X[:, 0], X[:, 1], c=ward.labels_, cmap='rainbow')
plt.title('Ward Clustering')
plt.show()
```
运行以上代码,可以得到一个树状图和一个散点图。树状图可以用于观察聚类结果的分组情况,散点图则可以更直观地展示聚类效果。
注意,以上代码中使用了`ward.distance_matrix_`属性来获取Ward算法计算得到的距离矩阵,这个属性只在`linkage='ward'`时才可用,如果使用其他聚类算法,需要根据具体情况选择相应的属性或方法。
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