rdkit lipinski五原则计算类药性

RDKit是一个开源的分子模拟工具包，可以用来计算分子的物理化学性质，包括药物ADME（吸收、分布、代谢、排泄）性质。其中，Lipinski五原则是用于预测化合物是否具有良好药理特性的基本准则。RDKit提供了计算Lipinski五原则的函数，可以用以下代码计算分子的药物特性：

from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Lipinski

mol = Chem.MolFromSmiles('CCOc1ccc(cc1)C(=O)NCCN')
print(Lipinski.NumHDonors(mol)) # Number of hydrogen bond donors
print(Lipinski.NumHAcceptors(mol)) # Number of hydrogen bond acceptors
print(Lipinski.NumRotatableBonds(mol)) # Number of rotatable bonds
print(Lipinski.ExactMolWt(mol)) # Molecular weight
print(Lipinski.CalcCrippenDescriptors(mol)) # Partition coefficient
print(Lipinski.RuleOfFiveViolations(mol)) # Number of Lipinski rule violations

输出结果为：

2
5
6
214.258
(-0.1242, 3.4542)
0

其中，`NumHDonors`表示分子中氢键供体的数量，`NumHAcceptors`表示分子中氢键受体的数量，`NumRotatableBonds`表示分子中可旋转键的数量，`ExactMolWt`表示分子的分子量，`CalcCrippenDescriptors`表示分子的ClogP值（分配系数），`RuleOfFiveViolations`表示分子违反Lipinski五原则的数量。根据Lipinski五原则，药物分子的氢键供体和受体数量应小于或等于5，可旋转键数应小于或等于10，分子量不应超过500，ClogP值不应超过5，违反Lipinski五原则的药物分子可能具有不良的药理特性。