X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(features, labels, test_size=0.3, random_state=42)

时间: 2023-08-28 22:18:17 浏览: 183
这段代码使用了Python中的train_test_split()函数进行训练集和测试集的划分。其中,features代表特征数据,labels代表标签数据。test_size参数指定了测试集占整个数据集的比例,这里为0.3,即测试集占30%。random_state参数用于设定随机数种子,保证多次运行时划分结果相同。最终,划分结果分别保存在X_train, X_test, y_train, y_test这四个变量中。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* *2* *3* [python机器学习 train_test_split()函数用法解析及示例 划分训练集和测试集 以鸢尾数据为例 入门级讲解](https://blog.csdn.net/weixin_48964486/article/details/122866347)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v92^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"] [ .reference_list ]
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帮我为下面的代码加上注释:class SimpleDeepForest: def __init__(self, n_layers): self.n_layers = n_layers self.forest_layers = [] def fit(self, X, y): X_train = X for _ in range(self.n_layers): clf = RandomForestClassifier() clf.fit(X_train, y) self.forest_layers.append(clf) X_train = np.concatenate((X_train, clf.predict_proba(X_train)), axis=1) return self def predict(self, X): X_test = X for i in range(self.n_layers): X_test = np.concatenate((X_test, self.forest_layers[i].predict_proba(X_test)), axis=1) return self.forest_layers[-1].predict(X_test[:, :-2]) # 1. 提取序列特征(如:GC-content、序列长度等) def extract_features(fasta_file): features = [] for record in SeqIO.parse(fasta_file, "fasta"): seq = record.seq gc_content = (seq.count("G") + seq.count("C")) / len(seq) seq_len = len(seq) features.append([gc_content, seq_len]) return np.array(features) # 2. 读取相互作用数据并创建数据集 def create_dataset(rna_features, protein_features, label_file): labels = pd.read_csv(label_file, index_col=0) X = [] y = [] for i in range(labels.shape[0]): for j in range(labels.shape[1]): X.append(np.concatenate([rna_features[i], protein_features[j]])) y.append(labels.iloc[i, j]) return np.array(X), np.array(y) # 3. 调用SimpleDeepForest分类器 def optimize_deepforest(X, y): X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2) model = SimpleDeepForest(n_layers=3) model.fit(X_train, y_train) y_pred = model.predict(X_test) print(classification_report(y_test, y_pred)) # 4. 主函数 def main(): rna_fasta = "RNA.fasta" protein_fasta = "pro.fasta" label_file = "label.csv" rna_features = extract_features(rna_fasta) protein_features = extract_features(protein_fasta) X, y = create_dataset(rna_features, protein_features, label_file) optimize_deepforest(X, y) if __name__ == "__main__": main()

import cv2 from skimage.feature import hog # 加载LFW数据集 from sklearn.datasets import fetch_lfw_people lfw_people = fetch_lfw_people(min_faces_per_person=70, resize=0.4) # 将数据集划分为训练集和测试集 from sklearn.model_selection import train_test_split X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(lfw_people.images, lfw_people.target, test_size=0.2, random_state=42) # 图像预处理和特征提取 from skimage import exposure import numpy as np train_features = [] for i in range(X_train.shape[0]): # 将人脸图像转换为灰度图 gray_img = cv2.cvtColor(X_train[i], cv2.COLOR_BGR2GRAY) # 归一化像素值 gray_img = cv2.normalize(gray_img, None, 0, 1, cv2.NORM_MINMAX, cv2.CV_32F) # 计算HOG特征 hog_features, hog_image = hog(gray_img, orientations=9, pixels_per_cell=(8, 8), cells_per_block=(2, 2), block_norm='L2', visualize=True, transform_sqrt=False) # 将HOG特征作为样本特征 train_features.append(hog_features) train_features = np.array(train_features) train_labels = y_train test_features = [] for i in range(X_test.shape[0]): # 将人脸图像转换为灰度图 gray_img = cv2.cvtColor(X_test[i], cv2.COLOR_BGR2GRAY) # 归一化像素值 gray_img = cv2.normalize(gray_img, None, 0, 1, cv2.NORM_MINMAX, cv2.CV_32F) # 计算HOG特征 hog_features, hog_image = hog(gray_img, orientations=9, pixels_per_cell=(8, 8), cells_per_block=(2, 2), block_norm='L2', visualize=True, transform_sqrt=False) # 将HOG特征作为样本特征 test_features.append(hog_features) test_features = np.array(test_features) test_labels = y_test # 训练模型 from sklearn.naive_bayes import GaussianNB gnb = GaussianNB() gnb.fit(train_features, train_labels) # 对测试集中的人脸图像进行预测 predict_labels = gnb.predict(test_features) # 计算预测准确率 from sklearn.metrics import accuracy_score accuracy = accuracy_score(test_labels, predict_labels) print('Accuracy:', accuracy)

优化这段代码:import pandas as pd import numpy as np from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.feature_selection import SelectKBest, f_classif from sklearn.model_selection import train_test_split, GridSearchCV from sklearn.metrics import accuracy_score # 读取Excel文件 data = pd.read_excel("output.xlsx") # 提取特征和标签 features = data.iloc[:, 1:].values labels = np.where(data.iloc[:, 0] > 59, 1, 0) # 特征选择 selector = SelectKBest(score_func=f_classif, k=11) selected_features = selector.fit_transform(features, labels) # 划分训练集和测试集 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(selected_features, labels, test_size=0.2, random_state=42) # 创建随机森林分类器 rf_classifier = RandomForestClassifier() # 定义要调优的参数范围 param_grid = { 'n_estimators': [50, 100, 200], # 决策树的数量 'max_depth': [None, 5, 10], # 决策树的最大深度 'min_samples_split': [2, 5, 10], # 拆分内部节点所需的最小样本数 'min_samples_leaf': [1, 2, 4] # 叶节点上所需的最小样本数 } # 使用网格搜索进行调优 grid_search = GridSearchCV(rf_classifier, param_grid, cv=5) grid_search.fit(X_train, y_train) # 输出最佳参数组合和对应的准确率 print("最佳参数组合:", grid_search.best_params_) print("最佳准确率:", grid_search.best_score_) # 使用最佳参数组合训练模型 best_rf_classifier = grid_search.best_estimator_ best_rf_classifier.fit(X_train, y_train) # 预测 y_pred = best_rf_classifier.predict(X_test) # 计算准确率 accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) # 打印最高准确率分类结果 print("最高准确率分类结果:", accuracy)

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