conda安装sratoolkit

### 如何使用 Conda 安装 SRA Toolkit

为了通过 Conda 安装 SRA Toolkit，需先确认已正确配置好 Conda 环境。Conda 是一个开源的包管理和环境管理系统，允许安装多个版本的软件包及其依赖项，并可在隔离环境中切换使用[^1]。

#### 创建并激活新的 Conda 环境 (可选)

如果希望在一个独立的环境中安装 SRA Toolkit，则可以创建一个新的 Conda 环境：

conda create --name sra_env python=3.9
conda activate sra_env

这一步骤并非强制执行，但如果担心与其他工具冲突或想要保持系统的整洁有序，建议这样做。

#### 添加 Bioconda 渠道

SRA Toolkit 可以从 Bioconda 频道获得支持。Bioconda 提供了大量的生物信息学相关软件包，在此之前应确保已经添加了 `bioconda` 和 `conda-forge` 渠道：

conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge

上述命令会按照优先级顺序依次添加默认渠道、Bioconda 和 Conda Forge 到用户的频道列表中。

#### 使用 Conda 安装 SRA Toolkit

完成以上准备工作之后，可以通过下面这条简单的指令来安装 SRA Toolkit:

conda install sra-tools

该命令将会自动解析所有必要的依赖关系并将它们一同下载下来进行安装。

一旦成功安装完毕，就可以利用 SRA Toolkit 中的各种功能来进行 NCBI Sequence Read Archive 数据集的操作处理工作了。