在lammps里,采用read_dump方法,创建一个简单的FCC立方晶格结构,晶格常数为8并给出正确的完整具体事例
时间: 2024-09-16 07:06:19 浏览: 151
LAMMPS常用建模方法总结.rar_lammps_lammps 建模_lammps如何建模_lammps建模_lammps怎么
5星 · 资源好评率100%
在LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)这款分子动力学模拟软件中,如果你想通过`read_dump`命令创建一个简单的面心立方(FCC)晶体结构,首先你需要定义一个数据文件,其中包含原子的位置、类型等信息。以下是一个创建FCC结构并读取到LAMMPS的数据集中的完整示例:
```bash
# 创建一个名为lattice.dump的数据文件(假设我们使用文本格式)
echo -e "0.0\n0.0\n0.0" > lattice.dump # 第一行是标题行,这里仅用于描述
# FCC晶体每个顶点有4个原子,我们可以设置一个原子类型
for i in {1..4}; do
x=$(echo "scale=6; $i * 8 / sqrt(3)" | bc)
y=$(echo "scale=6; $x / 2" | bc)
z=$(echo "scale=6; $y / sqrt(3)" | bc)
echo "$x $y $z atom_type 1" >> lattice.dump
done
# 现在,在LAMMPS的命令行中,你可以使用read_dump命令读取这个数据
lmp < your_lammps_script.txt
```
在这个`your_lammps_script.txt`中,通常会包含以下内容,初始化系统并读取刚生成的dump文件:
```lmp
units metal
atom_style atomic
boundary p p p
# 如果你还没有定义atom_type 1,可以添加如下命令:
pair_style lj/cut 8.0
pair_coeff * * 1.0 0.5
read_data lattice.dump
create_box 0 0 0 cubic 8.0
minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 force
```
这里,`lj/cut`是LJ(Lennard-Jones)势能模型,`cubic`指定立方单元,`8.0`是边长,`minimize`是对系统进行快速能量最小化。
阅读全文