import numpy as np import pandas as pd data = pd.read_csv("data/预处理.csv", header=None) data = np.array(data) cluster = [] 按第二个到第十四个标签分类 for i in range(178): if len(cluster) == 0: cluster.append([0]) else: m = 0 for j in range(len(cluster)): n = 0 for x in range(1, 14): if data[i][x] == data[j][x]: n = n + 1 if n == 2: cluster[j].append(i) m = 1 if m == 0: cluster.append([i]) for i in range(len(cluster)): for j in range(len(cluster)): if cluster[i] == cluster[j] and i != j: cluster[j] = 0 定义函数来判断两个集合是否相似 def is_similar(set1, set2): for item in set1: if item not in set2: return False return True xiu1 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 1: xiu1.append(t) xiu2 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 2: xiu2.append(t) xiu3 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 3: xiu3.append(t) #修改代码,输出xiu1, xiu2, xiu3在同时满足13个条件属性下的下近似集合 approx_xiu2 = [t for t in xiu2 if is_similar(data[t][1:14], data[x][1:14]) for x in xiu2] approx_xiu3 = [t for t in xiu3 if is_similar(data[t][1:14], data[x][1:14]) for x in xiu3] print(f"xiu1 在第{col}个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu1) print(f"xiu2 在第{col}个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu2) print(f"xiu3 在第{col}个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu3)

时间: 2024-01-15 13:03:29 浏览: 143
在你的代码中,有一些问题需要修正。以下是修正后的代码: ```python import numpy as np import pandas as pd data = pd.read_csv("data/预处理.csv", header=None) data = np.array(data) cluster = [] # 按第二个到第十四个标签分类 for i in range(178): if len(cluster) == 0: cluster.append([0]) else: m = 0 for j in range(len(cluster)): n = 0 for x in range(1, 14): if data[i][x] == data[j][x]: n = n + 1 if n == 2: cluster[j].append(i) m = 1 if m == 0: cluster.append([i]) for i in range(len(cluster)): for j in range(len(cluster)): if cluster[i] == cluster[j] and i != j: cluster[j] = 0 # 定义函数来判断两个集合是否相似 def is_similar(set1, set2): for item in set1: if item not in set2: return False return True xiu1 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 1: xiu1.append(t) xiu2 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 2: xiu2.append(t) xiu3 = [] for t in range(178): if data[t][0] == 3: xiu3.append(t) # 输出xiu1, xiu2, xiu3在同时满足13个条件属性下的下近似集合 approx_xiu1 = [t for t in xiu1 if all(is_similar(data[t][1:14], data[x][1:14]) for x in xiu1)] approx_xiu2 = [t for t in xiu2 if all(is_similar(data[t][1:14], data[x][1:14]) for x in xiu2)] approx_xiu3 = [t for t in xiu3 if all(is_similar(data[t][1:14], data[x][1:14]) for x in xiu3)] print("xiu1 在同时满足13个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu1) print("xiu2 在同时满足13个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu2) print("xiu3 在同时满足13个条件属性下的下近似集合:", approx_xiu3) ``` 现在,代码会输出xiu1、xiu2和xiu3在同时满足13个条件属性下的下近似集合。希望对你有所帮助!
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#导入所需库 import numpy as np import pandas as pd from sklearn.preprocessing import LabelEncoder from keras.utils import to_categorical from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense from sklearn.model_selection import KFold #读入数据 train_data = pd.read_csv('ProSeqs_Train.txt', delimiter=' ', header=None) test_data = pd.read_csv('ProSeqs_Test.txt', delimiter=' ', header=None) #预处理训练集数据 X = train_data.iloc[:, 2:].values y = train_data.iloc[:, 1].values le = LabelEncoder() y = le.fit_transform(y) y = to_categorical(y) #定义模型 model = Sequential() model.add(Dense(64, input_dim=X.shape[1], activation='relu')) model.add(Dense(32, activation='relu')) model.add(Dense(2, activation='softmax')) model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=['accuracy']) #K折交叉验证训练模型 kf = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) fold_scores = [] for train_index, valid_index in kf.split(X): train_X, train_y = X[train_index], y[train_index] valid_X, valid_y = X[valid_index], y[valid_index] model.fit(train_X, train_y, validation_data=(valid_X, valid_y), epochs=50, batch_size=32, verbose=2) fold_scores.append(model.evaluate(valid_X, valid_y, verbose=0)[1]) print('KFold cross-validation accuracy: {:.2f}%'.format(np.mean(fold_scores) * 100)) #预处理测试集数据 test_X = test_data.iloc[:, 1:].values #预测测试集结果 preds = model.predict(test_X) preds = np.argmax(preds, axis=1) #保存预测结果至文件中 np.savetxt('preds.txt', preds, fmt='%d') #输出预测结果 print('Predictions:') print(preds)该蛋白质功能预测实验涉及分类模型的理论基础

from keras.models import Sequential from keras.layers import Dense, Activation # 定义模型结构 model = Sequential() model.add(Dense(units=16, input_shape=(4,))) model.add(Activation('relu')) model.add(Dense(16)) model.add(Activation('relu')) model.add(Dense(3)) model.add(Activation('softmax')) #定义损失函数和优化器,并编译 model.compile(loss='categorical_crossentropy', optimizer='adam', metrics=["accuracy"]) import pandas as pd from sklearn.model_selection import train_test_split from keras.utils import np_utils filename = 'data\iris.data' data = pd.read_csv(filename, header = None) data.columns = ['sepal length','sepal width','petal length','petal width','class'] data.iloc[0:5,:] #数据预处理 #convert classname to integer data.loc[ data['class'] == 'Iris-setosa', 'class' ] = 0 data.loc[ data['class'] == 'Iris-versicolor', 'class' ] = 1 data.loc[ data['class'] == 'Iris-virginica', 'class' ] = 2 #data X = data.iloc[:,0:4].values.astype(float) y = data.iloc[:,4].values.astype(int) train_x, test_x, train_y, test_y = train_test_split(X, y, train_size=0.8, test_size=0.2, random_state=0) #keras多分类问题需要将类型转化为独热矩阵 #与pd.get_dummies()函数作用一致 train_y_ohe = np_utils.to_categorical(train_y, 3) test_y_ohe = np_utils.to_categorical(test_y, 3) #print(test_y_ohe ) #训练模型 model.fit(train_x, train_y_ohe, epochs=50, batch_size=1, verbose=2, validation_data=(test_x,test_y_ohe)) # 评估模型 loss, accuracy = model.evaluate(test_x, test_y_ohe, verbose=2) print('loss = {},accuracy = {} '.format(loss,accuracy) ) # 查看预测结果 classes = model.predict(test_x, batch_size=1, verbose=2) print('测试样本数:',len(classes)) print("分类概率:\n",classes)

import tensorflow as tf import pandas as pd import numpy as np # 读取训练数据,名为"public.train.csv"的CSV文件,并将其转换为一个二维数组datatrain。 df = pd.read_csv(r"public.train.csv", header=None) datatrain = np.array(df) # 从datatrain中提取输入数据和输出数据,其中输入数据是datatrain中的前20列数据,输出数据是datatrain的第21列数据。 # 提取特征值,形成输入数据 dataxs = datatrain[1:, :20] dataxshlen = len(dataxs) # 训练输入数据的行数 dataxsllen = len(dataxs[0]) # 训练输入数据的列数 #接下来,将输入数据中的每个元素从字符串类型转换为浮点型。 for i in range(dataxshlen): for j in range(dataxsllen): dataxs[i][j] = float(dataxs[i][j]) # 提取特征值,形成输出数据 datays = datatrain[1:, [20]] datayshlen = dataxshlen # 训练输出数据的行数 dataysllen = len(datays[0]) # 训练输出数据的列数 #接下来,将输出数据中的每个元素从字符串类型转换为浮点型。 for i in range(datayshlen): for j in range(dataysllen): datays[i][j] = float(datays[i][j]) # 最后打印输出训练数据输入数据、训练数据输出数据以及它们的行数和列数。 print("______训练数据输入数据_______") print(dataxs) print("______训练数据输出数据_______") print(datays) print("______训练数据输入数据行数、列数;训练数据输出数据行数、列数_______") print(dataxshlen, dataxsllen, datayshlen, dataysllen)根据这段代码续写DNN和LSTM预测模型

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