使用PCA、Isomap对乳腺癌数据集进行降维并进行可视化
时间: 2024-01-08 18:04:33 浏览: 181
乳腺癌数据分析报告和数据集
好的,我可以为您解答这个问题。
首先,我们需要加载乳腺癌数据集,并将其分为特征和标签。
```python
from sklearn.datasets import load_breast_cancer
import numpy as np
data = load_breast_cancer()
X = data.data
y = data.target
```
接下来,我们使用PCA和Isomap对数据进行降维,并将结果可视化。
```python
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.manifold import Isomap
# 使用PCA进行降维
pca = PCA(n_components=2)
X_pca = pca.fit_transform(X)
# 使用Isomap进行降维
isomap = Isomap(n_components=2)
X_isomap = isomap.fit_transform(X)
# 可视化PCA和Isomap的结果
plt.figure(figsize=(10, 5))
plt.subplot(121)
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y)
plt.title('PCA')
plt.subplot(122)
plt.scatter(X_isomap[:, 0], X_isomap[:, 1], c=y)
plt.title('Isomap')
plt.show()
```
这段代码将会生成一个大小为10x5的画布,其中包含两个子图。左边的子图显示了使用PCA进行降维后的结果,右边的子图显示了使用Isomap进行降维后的结果。每个数据点的颜色表示其所属的类别。
您可以根据需要进一步调整PCA和Isomap的参数,以达到更好的降维效果。
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