AutoDock Vina Binding Pocket********* --center_x 0.0 --center_y 0.0 --center_z 0.0 --size_x 11.0 --size_y 11.0 --size_z 11.0 *********AutoDock Grid Option********* npts 29 29 29 # num. grid points in xyz spacing 0.375 # spacing (A) gridcenter 0.000 0.000 0.000 # xyz-coordinates or auto *********LeDock Binding Pocket********* Binding pocket -5.5 5.5 -5.5 5.5 -5.5 5.5 BoxCode(box_600) = showbox -5.5, 5.5, -5.5, 5.5, -5.5, 5.5
时间: 2023-08-12 18:05:23 浏览: 168
autodock-vina及视频教程.rar
根据提供的引用内容,AutoDock Vina和LeDock都是用于分子对接的软件工具。AutoDock Vina是一个开源的分子对接软件,可以通过GitHub上的链接下载和使用\[1\]。在使用AutoDock Vina时,可以通过设置参数来定义配体和受体的位置和大小,例如exhaustiveness、center_x、center_y、center_z、size_x、size_y和size_z等参数\[2\]。而LeDock是另一个分子对接软件,它使用BoxCode来定义配体和受体的结合位点,通过设置坐标范围来确定结合位点的位置\[3\]。这些软件工具可以帮助研究人员进行分子对接实验,以寻找潜在的药物分子。
#### 引用[.reference_title]
- *1* [AutoDock Vina 全套软件安装教程(Linux)](https://blog.csdn.net/m0_67843839/article/details/126822254)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *2* *3* [Autodock Vina Linux安装教程](https://blog.csdn.net/weixin_43135178/article/details/129707139)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
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