ggcorrplot()参数 pmat只显示p<0.01的变量,其他留空白
时间: 2024-03-10 21:45:58 浏览: 116
好的,你的问题是关于 ggcorrplot() 函数的参数 pmat 的使用。如果我理解正确,你想知道如何只显示 p 值小于 0.01 的变量,而其他变量留空白。如果是这样,你可以按照以下步骤操作:
1. 首先,在使用 ggcorrplot() 函数时,需要生成一个相关系数矩阵,其中包含每个变量之间的相关系数以及相应的 p 值。你可以使用 cor.test() 函数来计算每对变量之间的相关性和 p 值,并将其存储在矩阵中。
2. 接下来,你需要创建一个函数来控制矩阵中每个单元格的填充颜色。在这个函数中,你可以使用 ifelse() 函数来检查 p 值是否小于 0.01,如果是,则将单元格填充为红色,否则将其留空。
3. 最后,你可以将这个函数传递给 ggcorrplot() 函数的 colors 参数,以控制图形中每个单元格的填充颜色。
下面是一个示例代码,可以帮助你更好地理解如何实现:
```
library(ggplot2)
library(ggcorrplot)
# 生成相关系数矩阵
data(mtcars)
cor_mat <- cor.test(mtcars[,1:6])$p.value
dim(cor_mat) <- c(6,6)
# 定义函数来控制单元格的填充颜色
my_color <- function(x) {
ifelse(x < 0.01, "red", "white")
}
# 绘制相关性矩阵图
ggcorrplot(cor_mat, colors = my_color)
```
请注意,上面的示例代码仅供参考,你需要根据自己的数据和需求进行相应的修改。
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