data, target = data.to(device), target.to(device).float().unsqueeze(1) 什么意思
时间: 2024-05-26 16:12:29 浏览: 131
这段代码涉及到了 PyTorch 库中的 Tensor 类型和一些常用的操作。
首先,`data` 和 `target` 是两个 Tensor 对象,它们被分别移到了 `device` 设备上,即 GPU 或 CPU。
接着,`target` 被转换成了浮点型,并在第一维上增加了一个维度,即从原来的 `(batch_size,)` 变成了 `(batch_size, 1)`。这么做的原因是为了将 `target` 转换成 PyTorch 中的标准形式,即 `(batch_size, num_classes)`,其中 `num_classes` 为分类问题中的类别数。这里的 `num_classes` 取值为 1,因此需要在第一维上增加一个维度。
最后,这两个 Tensor 对象被赋值给了 `data` 和 `target` 变量,以供后续使用。
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def predict_one_img(model, img_dataset, args): # def predict_one_img(model, img_dataset, data, target, args): dataloader = DataLoader(dataset=img_dataset, batch_size=1, num_workers=0, shuffle=False) model.eval() test_dice = DiceAverage(args.n_labels) # target = to_one_hot_3d(label, args.n_labels) with torch.no_grad(): for data ,target in tqdm(dataloader, total=len(dataloader)): # data = data.to(device) data, target = data.float(), target.long() target = to_one_hot_3d(target, args.n_labels) data, target = data.to(device), target.to(device) # print(data.shape) # print(target.shape) output = model(data) # output = nn.functional.interpolate(output, scale_factor=(1//args.slice_down_scale,1//args.xy_down_scale,1//args.xy_down_scale), mode='trilinear', align_corners=False) # 空间分辨率恢复到原始size img_dataset.update_result(output.detach().cpu()) pred = img_dataset.recompone_result() pred = torch.argmax(pred, dim=1) pred_img = to_one_hot_3d(pred, args.n_labels) pred_img=pred_img.to(device) test_dice.update(pred_img, target) test_dice = OrderedDict({'Dice_liver': test_dice.avg[1]}) if args.n_labels == 3: test_dice.update({'Dice_tumor': test_dice.avg[2]}) pred = np.asarray(pred.numpy(), dtype='uint8') if args.postprocess: pass # TO DO pred = sitk.GetImageFromArray(np.squeeze(pred, axis=0)) return test_dice, pred
这是一个用于预测单张图像的函数,接收一个模型、一个图像数据集和一些参数作为输入。函数首先将图像数据集加载到一个Dataloader中,然后将模型设置为评估模式并初始化一个DiceAverage对象,该对象用于计算评估指标(这里是Dice系数)。在没有梯度的情况下,对于每个数据和目标对,函数将数据和目标转换为模型所需的格式(浮点数和one-hot编码),并将它们传递给模型进行预测。预测结果被转换回原来的空间分辨率,然后被添加到图像数据集中。最后,预测结果被重新组合成一个numpy数组,并被转换为一个SimpleITK图像对象并返回。如果需要,可以在预测之后对预测结果进行后处理。函数返回测试指标和预测结果。
def train(model, train_loader, optimizer, loss_func, n_labels, alpha): print("=======Epoch:{}=======lr:{}".format(epoch,optimizer.state_dict()['param_groups'][0]['lr'])) model.train() train_loss = LossAverage() train_dice = DiceAverage(n_labels) for idx, (data, target) in tqdm(enumerate(train_loader),total=len(train_loader)): data, target = data.float(), target.long() # data, target = data.cuda().float(), target.cuda().long() target = to_one_hot_3d(target,n_labels) data, target = data.to(device), target.to(device) # print(data.shape) # data, target = data.cuda(), target.cuda() optimizer.zero_grad() output = model(data) loss0 = loss_func(output[0], target) loss1 = loss_func(output[1], target) loss2 = loss_func(output[2], target) loss3 = loss_func(output[3], target) loss = loss3 + alpha * (loss0 + loss1 + loss2) loss.backward() optimizer.step() train_loss.update(loss3.item(),data.size(0)) train_dice.update(output[3], target) train_log = OrderedDict({'Train_Loss': train_loss.avg, 'Train_dice_CTV': train_dice.avg[1]})if n_labels == 5: train_log.update({'Train_dice_intestine': train_dice.avg[2], 'Train_dice_Rectum': train_dice.avg[3], 'Train_dice_Bladder': train_dice.avg[4] }) return train_log, train_loss.avg, train_dice.avg[1]
这是一个用于训练神经网络模型的函数。它包含以下参数:
- model: 要训练的模型
- train_loader: 用于训练的数据加载器
- optimizer: 优化器,用于更新模型参数
- loss_func: 损失函数,用于计算模型输出与真实标签之间的差异
- n_labels: 标签的数量
- alpha: 控制不同损失项之间权重的超参数
在函数中,首先打印当前的 epoch 和学习率,然后将模型设置为训练模式。接下来,遍历训练数据加载器中的每个 batch,将数据和标签转换为 PyTorch 张量,并将它们移动到指定的设备上。
然后,将优化器的梯度清零,使用模型对数据进行前向传递,计算模型输出与真实标签之间的损失,并计算加权后的总损失。最后,反向传播并更新模型参数。在训练过程中,同时记录平均损失和每个类别的 Dice 系数,并返回这些值。
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