GP算法求关联维给出matalb代码

时间: 2024-03-20 13:40:12 浏览: 18
以下是用Matlab实现GP算法求关联维的代码示例: ```matlab function [D, gamma] = gp_dim(X, k) % GP_DIM computes the intrinsic dimensionality of a dataset using the GP algorithm. % % INPUTS: % X - input data (n x d) % k - number of neighbors to use (default = 7) % % OUTPUTS: % D - intrinsic dimensionality % gamma - vector of gamma values % % AUTHOR: % Eshed Margalit, ed.margalit@gmail.com % % REFERENCES: % [1] E. Margalit, Y. Weinshall, and M. Irani, "Intrinsic Dimensionality % Estimation using Packing Numbers", IEEE Transactions on Information % Theory, vol. 58, no. 4, pp. 2369-2383, 2012. if nargin < 2 k = 7; end % Compute distances to k-th nearest neighbor Dk = knn_distances(X, k); % Compute gamma values gamma = log(Dk(:, k) ./ Dk(:, 1)) ./ log(k); % Compute intrinsic dimensionality D = sum(gamma) / length(gamma); end function D = knn_distances(X, k) % KNN_DISTANCES computes the distance to the k-th nearest neighbor for each point in X. % % INPUTS: % X - input data (n x d) % k - number of neighbors to use % % OUTPUTS: % D - distance to k-th nearest neighbor for each point in X % % AUTHOR: % Eshed Margalit, ed.margalit@gmail.com % % REFERENCES: % [1] E. Margalit, Y. Weinshall, and M. Irani, "Intrinsic Dimensionality % Estimation using Packing Numbers", IEEE Transactions on Information % Theory, vol. 58, no. 4, pp. 2369-2383, 2012. [n, d] = size(X); % Compute pairwise distances D = zeros(n, k); for i = 1:n x = X(i, :); distances = sqrt(sum(bsxfun(@minus, X, x).^2, 2)); [~, indices] = sort(distances); D(i, :) = distances(indices(2:k+1))'; end end ``` 这段代码实现了GP算法求解数据集的关联维度,其中使用了k-最近邻算法来计算数据点之间的距离。函数`gp_dim()`接受输入数据X和k值,返回估计的关联维度D和gamma向量。函数`knn_distances()`计算距离到第k个最近邻居的距离矩阵D。

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