ubuntu下lammps的并行安装

时间: 2023-05-31 15:21:00 浏览: 410
### 回答1: 在Ubuntu下安装LAMMPS并行版本,需要先安装MPI库,如OpenMPI或MPICH。然后下载LAMMPS源代码,解压后进入src目录,执行make mpi -j4命令进行编译。其中,-j4表示使用4个线程进行编译,可以根据实际情况进行调整。编译完成后,可以在src目录下找到lmp_mpi可执行文件,即为LAMMPS并行版本。 ### 回答2: 在Ubuntu系统下,对于LAMMPS的并行安装需要进行以下步骤: 1. 安装编译器和MPI库 LAMMPS需要MPI库支持进行并行计算,因此需要先安装编译器和MPI库。我们可以使用apt-get命令进行安装: sudo apt-get install g++ libopenmpi-dev 2. 下载LAMMPS 可以通过LAMMPS官网下载最新版本的LAMMPS源码包,也可以使用git命令下载: git clone https://github.com/lammps/lammps.git 3. 编译并行版本的LAMMPS 进入LAMMPS源码目录,执行make命令编译并行版本的LAMMPS: cd lammps/src make mpi 编译成功后,将会在LAMMPS源码目录下生成一个lmp_mpi可执行文件。这个可执行文件就是并行版本的LAMMPS。 4. 运行并行版本的LAMMPS 在命令行中运行并行版本的LAMMPS,需要使用mpiexec命令,指定使用的进程数和运行LAMMPS的命令: mpiexec -n 4 ./lmp_mpi -in input_file.in 以上命令中,-n 4表示使用4个进程,./lmp_mpi是并行版本的LAMMPS可执行文件,-in input_file.in表示运行的输入文件。 通过以上步骤,就可以在Ubuntu系统下成功进行LAMMPS的并行安装,并进行应用。需要注意的是,LAMMPS的并行计算需要有足够的CPU核心和内存支持,否则可能会出现运行失败的情况。 ### 回答3: LAMMPS是一种用于分子动力学模拟的开源程序,在Ubuntu系统下进行安装需要考虑到其并行化的特性。下面将为大家详细讲述如何在Ubuntu下安装LAMMPS并实现并行化。 1. 环境准备 在开始安装LAMMPS之前,需要先配置好相应的环境。需要确保Ubuntu系统中安装的是MPI并行库(如MPICH,OpenMPI等)。 2. 下载LAMMPS 从LAMMPS官网下载最新版的源代码并解压缩。在终端中进入解压后的文件夹中。 3. 编译 在终端中输入以下命令进行编译: make mpi 在编译过程中,需要先检查一下是否已经安装了必备的编译软件。如果没有安装则需要先进行安装。比如,如果提示没有安装g++,则需要使用以下命令安装: sudo apt-get install g++ 如果在编译过程中出现错误,则需要根据错误信息进行相应的处理。 4. 并行化 LAMMPS支持许多不同的并行化方式,包括MPI并行化方式。在Ubuntu系统中,使用MPI并行库可以实现LAMMPS的并行化。 在终端中输入以下命令以使用4个进程进行并行计算: mpiexec -n 4 lmp_mpi -in input_file.in 其中,input_file.in为输入文件名,可以根据需要进行修改。使用具体的进程数进行计算时,需要调整-n后的数字。 5. 测试 在执行并行化计算之前,需要进行一些测试以确保正确性。可以使用其自带的测试文件进行测试。 在终端中输入以下命令以运行测试: make test 在测试过程中出现错误时,需要根据错误信息进行相应的处理。 以上就是在Ubuntu系统下使用MPI并行化安装LAMMPS的详细过程。需要注意的是,不同的操作系统下安装方式可能会有所不同,具体可以参考相应的安装说明。

相关推荐

最新推荐

lammps安装方法.doc

本人刚刚接触LAMMPS,经过几天的摸索,终于把windows下LAMMPS的安装与运行解决掉了。拿出来与大家分享下。刚开始可能发现比较困难,但是装上之后才发现过程如此简单。现在LAMMPS主页上提供支持WINDOWS系统下LAMMPS的...

lammps实例3.pdf

lammps运行示例3,一般性分子模拟软件。 兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以 模拟软材料和固体物理系统。

lammps实例2.pdf

lammps运行示例2,一般性分子模拟软件。 兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以 模拟软材料和固体物理系统。

lammps-reaxff-机器学习-电化学.pdf

【lammps】:周五开课 石墨烯、金属材料模拟、纳米流体模拟分析;热传导模拟计算;金属、合金、高熵合金及材料切削模拟;离子辐照损伤模拟;MOFs材料建模分析;分子筛膜材料气体分离模拟分析。 【ReaxFF反应力场】 ...

lammps实例1.pdf

lammps运行示例,一般性分子模拟软件。兼容当前大多数的势能模型,编程水平高,计算效率高。可以模拟软材料和固体物理系统。

stc12c5a60s2 例程

stc12c5a60s2 单片机的所有功能的实例,包括SPI、AD、串口、UCOS-II操作系统的应用。

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire

【迁移学习在车牌识别中的应用优势与局限】: 讨论迁移学习在车牌识别中的应用优势和局限

![【迁移学习在车牌识别中的应用优势与局限】: 讨论迁移学习在车牌识别中的应用优势和局限](https://img-blog.csdnimg.cn/direct/916e743fde554bcaaaf13800d2f0ac25.png) # 1. 介绍迁移学习在车牌识别中的背景 在当今人工智能技术迅速发展的时代,迁移学习作为一种强大的技术手段,在车牌识别领域展现出了巨大的潜力和优势。通过迁移学习,我们能够将在一个领域中学习到的知识和模型迁移到另一个相关领域,从而减少对大量标注数据的需求,提高模型训练效率,加快模型收敛速度。这种方法不仅能够增强模型的泛化能力,提升识别的准确率,还能有效应对数据

margin-top: 50%;

margin-top: 50%; 是一种CSS样式代码,用于设置元素的上边距(即与上方元素或父级元素之间的距离)为其父元素高度的50%。 这意味着元素的上边距将等于其父元素高度的50%。例如,如果父元素的高度为100px,则该元素的上边距将为50px。 请注意,这个值只在父元素具有明确的高度(非auto)时才有效。如果父元素的高度是auto,则无法确定元素的上边距。 希望这个解释对你有帮助!如果你还有其他问题,请随时提问。

Android通过全局变量传递数据

在Activity之间数据传递中还有一种比较实用的方式 就是全局对象 实用J2EE的读者来说都知道Java Web的四个作用域 这四个作用域从小到大分别是Page Request Session和Application 其中Application域在应用程序的任何地方都可以使用和访问 除非是Web服务器停止 Android中的全局对象非常类似于Java Web中的Application域 除非是Android应用程序清除内存 否则全局对象将一直可以访问 1 定义一个类继承Application public class MyApp extends Application 2 在AndroidMainfest xml中加入全局变量 android:name " MyApp" 3 在传数据类中获取全局变量Application对象并设置数据 myApp MyApp getApplication ; myApp setName "jack" ; 修改之后的名称 4 在收数据类中接收Application对象 myApp MyApp getApplication ;">在Activity之间数据传递中还有一种比较实用的方式 就是全局对象 实用J2EE的读者来说都知道Java Web的四个作用域 这四个作用域从小到大分别是Page Request Session和Application 其中Application域在应用程序的任何地方都可以使用和 [更多]