将计算得到的晶格畸变能量作为特征,对结构进行聚类。python详细代码,使用Numpy库

时间: 2024-03-09 09:50:52 浏览: 18
以下是使用Numpy库进行K均值聚类的Python代码,其中假设已经计算得到了晶格畸变能量并存储在一个Numpy数组中: ```python import numpy as np from scipy.spatial.distance import cdist def k_means(features, k): # 随机选择k个聚类中心 centroids = features[np.random.choice(features.shape[0], k, replace=False)] while True: # 计算每个点到聚类中心的距离 distances = cdist(features, centroids, metric='euclidean') # 找到每个点所属的类别 labels = np.argmin(distances, axis=1) # 更新聚类中心 new_centroids = np.array([features[labels == i].mean(axis=0) for i in range(k)]) # 如果聚类中心没有发生变化,则停止聚类 if np.allclose(centroids, new_centroids): break centroids = new_centroids return labels # 假设features是一个(n, m)的Numpy数组,n是样本数,m是特征数 features = np.array([[1.2, 2.3, 4.5], [0.5, 1.2, 3.2], [2.3, 3.4, 5.6], [3.4, 5.6, 7.8], [1.2, 3.4, 4.5], [2.3, 4.5, 6.7]]) # 设置聚类数为3 k = 3 # 进行K均值聚类 labels = k_means(features, k) # 打印聚类结果 print(labels) ``` 在上面的代码中,`k_means`函数实现了K均值聚类算法,`features`是一个(n, m)的Numpy数组,其中n是样本数,m是特征数,`k`是聚类数。函数返回每个样本所属的类别。在主程序中,我们使用了一个假设的特征数组`features`,并将聚类数设置为3。最后,打印出了聚类结果。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

python 代码实现k-means聚类分析的思路(不使用现成聚类库)

主要介绍了python 代码实现k-means聚类分析(不使用现成聚类库),本文通过实例代码给大家介绍的非常详细,对大家的学习或工作具有一定的参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
recommend-type

Python实现简单层次聚类算法以及可视化

主要为大家详细介绍了Python实现简单层次聚类算法以及可视化,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们可以参考一下
recommend-type

python实现鸢尾花三种聚类算法(K-means,AGNES,DBScan)

主要介绍了python实现鸢尾花三种聚类算法(K-means,AGNES,DBScan),文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面随着小编来一起学习学习吧
recommend-type

k-means 聚类算法与Python实现代码

依次把集合里的元素与距离最近的聚类中心分为一类,放到对应该聚类中心的新的容器,一次聚类完成后求出新容器里个类的均值,对该类对应的聚类中心进行更新,再次进行聚类操作,迭代n次得到理想的结果 三、可视化展
recommend-type

python实现mean-shift聚类算法

本文实例为大家分享了python实现mean-shift聚类算法的具体代码,供大家参考,具体内容如下 1、新建MeanShift.py文件 import numpy as np # 定义 预先设定 的阈值 STOP_THRESHOLD = 1e-4 CLUSTER_THRESHOLD = 1e-1 #...
recommend-type

zigbee-cluster-library-specification

最新的zigbee-cluster-library-specification说明文档。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成

![实现实时数据湖架构:Kafka与Hive集成](https://img-blog.csdnimg.cn/img_convert/10eb2e6972b3b6086286fc64c0b3ee41.jpeg) # 1. 实时数据湖架构概述** 实时数据湖是一种现代数据管理架构,它允许企业以低延迟的方式收集、存储和处理大量数据。与传统数据仓库不同,实时数据湖不依赖于预先定义的模式,而是采用灵活的架构,可以处理各种数据类型和格式。这种架构为企业提供了以下优势: - **实时洞察:**实时数据湖允许企业访问最新的数据,从而做出更明智的决策。 - **数据民主化:**实时数据湖使各种利益相关者都可
recommend-type

解释minorization-maximization (MM) algorithm,并给出matlab代码编写的例子

Minorization-maximization (MM) algorithm是一种常用的优化算法,用于求解非凸问题或含有约束的优化问题。该算法的基本思想是通过构造一个凸下界函数来逼近原问题,然后通过求解凸下界函数的最优解来逼近原问题的最优解。具体步骤如下: 1. 初始化参数 $\theta_0$,设 $k=0$; 2. 构造一个凸下界函数 $Q(\theta|\theta_k)$,使其满足 $Q(\theta_k|\theta_k)=f(\theta_k)$; 3. 求解 $Q(\theta|\theta_k)$ 的最优值 $\theta_{k+1}=\arg\min_\theta Q(
recommend-type

JSBSim Reference Manual

JSBSim参考手册,其中包含JSBSim简介,JSBSim配置文件xml的编写语法,编程手册以及一些应用实例等。其中有部分内容还没有写完,估计有生之年很难看到完整版了,但是内容还是很有参考价值的。