基于mapreduce的聚类em算法实现,原理、步骤、Java代码
时间: 2023-11-22 08:56:48 浏览: 77
hadoop实现聚类算法
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EM算法是一种迭代算法,用于在具有隐变量的概率模型中估计参数。MapReduce是一种分布式计算框架,可用于处理大规模数据集。基于MapReduce的EM算法可以有效地处理大规模数据集。
以下是基于MapReduce的聚类EM算法的步骤:
1. 初始化K个聚类中心
2. 将数据集分成若干个数据块,并将每个数据块发送到Map任务中处理
3. 在Map任务中,计算每个数据点与每个聚类中心的距离,并将数据点分配给最近的聚类中心
4. 在Reduce任务中,根据分配给每个聚类中心的数据点计算新的聚类中心
5. 重复步骤3和4,直到满足停止条件为止(例如,聚类中心不再发生变化或达到最大迭代次数)
以下是基于MapReduce的聚类EM算法的Java代码实现:
```java
public class EMClustering {
public static class Map extends Mapper<LongWritable, Text, IntWritable, VectorWritable> {
private final static IntWritable one = new IntWritable(1);
private VectorWritable data = new VectorWritable();
public void map(LongWritable key, Text value, Context context) throws IOException, InterruptedException {
String line = value.toString();
String[] tokens = line.split(",");
double[] values = new double[tokens.length];
for (int i = 0; i < tokens.length; i++) {
values[i] = Double.parseDouble(tokens[i]);
}
data.set(new DenseVector(values));
context.write(one, data);
}
}
public static class Reduce extends Reducer<IntWritable, VectorWritable, IntWritable, VectorWritable> {
private List<Vector> points = new ArrayList<>();
private List<Cluster> clusters = new ArrayList<>();
public void setup(Context context) {
int k = context.getConfiguration().getInt("k", 2);
int maxIterations = context.getConfiguration().getInt("maxIterations", 10);
// Initialize k clusters randomly
for (int i = 0; i < k; i++) {
Vector randomPoint = points.get((int) (Math.random() * points.size()));
clusters.add(new Cluster(i, randomPoint));
}
// Run EM algorithm
for (int i = 0; i < maxIterations; i++) {
// E-step: assign points to clusters
for (Cluster cluster : clusters) {
cluster.clear();
}
for (Vector point : points) {
double maxDistance = Double.MAX_VALUE;
Cluster closestCluster = null;
for (Cluster cluster : clusters) {
double distance = distance(point, cluster.getCenter());
if (distance < maxDistance) {
maxDistance = distance;
closestCluster = cluster;
}
}
closestCluster.addPoint(point);
}
// M-step: recompute cluster centers
for (Cluster cluster : clusters) {
cluster.recomputeCenter();
}
}
}
private double distance(Vector v1, Vector v2) {
return Math.sqrt(v1.getDistanceSquared(v2));
}
}
public static void main(String[] args) throws Exception {
Configuration conf = new Configuration();
conf.setInt("k", Integer.parseInt(args[0]));
conf.setInt("maxIterations", Integer.parseInt(args[1]));
Job job = Job.getInstance(conf, "EM Clustering");
job.setJarByClass(EMClustering.class);
job.setMapperClass(Map.class);
job.setReducerClass(Reduce.class);
job.setOutputKeyClass(IntWritable.class);
job.setOutputValueClass(VectorWritable.class);
FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(args[2]));
FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(args[3]));
System.exit(job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1);
}
}
```
这段代码中,我们首先定义了一个Map任务和一个Reduce任务。在Map任务中,我们将每个数据点写入一个键值对中,并将键设置为1,以便在Reduce任务中对所有数据点进行聚合。在Reduce任务中,我们首先读取k和maxIterations参数,并随机初始化k个聚类中心。然后,我们重复执行E步骤和M步骤,直到满足停止条件。在E步骤中,我们将每个数据点分配给最近的聚类中心,并在M步骤中重新计算每个聚类中心的位置。最后,我们将聚类结果写入输出文件中。
需要注意的是,上述代码仅为示例代码,实际应用中可能需要进行一些优化,例如使用Combiner来减少网络传输量等。
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