可视化功能为在终端上通过左右键控制界面移动,

时间: 2024-02-19 08:02:28 浏览: 19
好的,你需要使用一个终端界面库来实现可视化功能。我推荐使用ncurses库,它是一个流行的终端界面库,可以在Linux和其他类Unix系统上使用。以下是一个使用ncurses库的例子,用于显示匹配结果: ```c #include <ncurses.h> #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <string.h> #define REF_FILE "ref.fa" #define RESULT_FILE "result.txt" #define MAX_LINE_LENGTH 1024 #define MAX_NAME_LENGTH 128 #define MAX_SEQ_LENGTH 10000 #define MAX_RESULTS 1000 typedef struct { char name[MAX_NAME_LENGTH]; int start; char seq[MAX_SEQ_LENGTH]; } sequence_t; typedef struct { int start; int end; int len; int score; } result_t; int n_results = 0; result_t results[MAX_RESULTS]; void load_ref(sequence_t *ref) { FILE *fp = fopen(REF_FILE, "r"); char buf[MAX_LINE_LENGTH]; int len = 0; while (fgets(buf, MAX_LINE_LENGTH, fp)) { if (buf[0] == '>') { if (len > 0) { ref->seq[len] = '\0'; len = 0; } sscanf(buf, ">%s", ref->name); } else { strncpy(ref->seq + len, buf, MAX_SEQ_LENGTH - len); len += strlen(buf) - 1; } } if (len > 0) { ref->seq[len] = '\0'; } fclose(fp); } void load_results(sequence_t *ref, sequence_t *seq) { FILE *fp = fopen(RESULT_FILE, "r"); char buf[MAX_LINE_LENGTH]; while (fgets(buf, MAX_LINE_LENGTH, fp)) { sscanf(buf, "%s %d %s", seq->name, &seq->start, seq->seq); int len = strlen(seq->seq); int score = 0; int i; for (i = 0; i < len; i++) { if (ref->seq[seq->start + i] == seq->seq[i]) { score++; } } result_t result; result.start = seq->start; result.end = seq->start + len - 1; result.len = len; result.score = score; results[n_results++] = result; } fclose(fp); } void print_result(WINDOW *win, sequence_t *ref, result_t *result) { char buf[MAX_LINE_LENGTH]; snprintf(buf, MAX_LINE_LENGTH, "%s:%d-%d (%d/%d)", ref->name, result->start, result->end, result->score, result->len); wprintw(win, buf); } void print_results(WINDOW *win, sequence_t *ref) { int i; for (i = 0; i < n_results; i++) { wmove(win, i, 0); print_result(win, ref, &results[i]); } wrefresh(win); } int main() { sequence_t ref; sequence_t seq; load_ref(&ref); load_results(&ref, &seq); initscr(); noecho(); cbreak(); keypad(stdscr, TRUE); int max_x, max_y; getmaxyx(stdscr, max_y, max_x); WINDOW *win = newwin(n_results, max_x, 0, 0); scrollok(win, TRUE); int pos_x = 0; int pos_y = 0; int scroll_x = 0; int scroll_y = 0; while (1) { wclear(win); print_results(win, &ref); wmove(win, pos_y - scroll_y, pos_x - scroll_x); wrefresh(win); int ch = getch(); switch (ch) { case KEY_LEFT: if (pos_x > 0) { pos_x--; } break; case KEY_RIGHT: if (pos_x < ref.start + strlen(ref.seq) - 1) { pos_x++; } break; case KEY_UP: if (pos_y > 0) { pos_y--; } break; case KEY_DOWN: if (pos_y < n_results - 1) { pos_y++; } break; case KEY_PPAGE: if (scroll_y > 0) { scroll_y--; } break; case KEY_NPAGE: if (scroll_y < n_results - max_y) { scroll_y++; } break; case 'q': endwin(); return 0; default: break; } } endwin(); return 0; } ``` 这个例子假设你的ref.fa文件包含一个基因序列,result.txt文件包含需要匹配的字串。程序会对每个字串进行匹配,在终端上显示匹配结果。你可以通过左右键控制光标在基因序列上移动,通过上下键控制匹配结果在终端上的位置。按下PageUp和PageDown键可以滚动终端窗口。按下'q'键退出程序。这个例子只是一个简单的演示,你需要根据你的需求修改代码才能实现你想要的功能。

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