批量从文件夹中找出子文件夹中的nrrd格式文件，转换成nii格式后以子文件夹命名统一保存在新文件夹中

可以使用Python中的SimpleITK库来实现这个功能。

首先需要安装SimpleITK库：

!pip install SimpleITK

然后，可以使用以下代码实现批量转换nrrd格式为nii格式并保存：

import os
import SimpleITK as sitk

# 定义原始文件夹和目标文件夹路径
input_folder_path = 'path/to/input/folder'
output_folder_path = 'path/to/output/folder'

# 遍历原始文件夹中的子文件夹
for root, dirs, files in os.walk(input_folder_path):
    for dir_name in dirs:
        # 定义当前子文件夹路径
        current_folder_path = os.path.join(root, dir_name)
        
        # 遍历当前子文件夹中的nrrd文件
        for file_name in os.listdir(current_folder_path):
            if file_name.endswith('.nrrd'):
                # 定义输入和输出文件路径
                input_file_path = os.path.join(current_folder_path, file_name)
                output_file_path = os.path.join(output_folder_path, dir_name + '.nii.gz')
                
                # 读取nrrd文件，并将其转换为nii格式
                image = sitk.ReadImage(input_file_path)
                sitk.WriteImage(image, output_file_path)

上述代码会遍历原始文件夹中的所有子文件夹，找出其中的nrrd格式文件，并将其转换为nii格式后以子文件夹命名保存在目标文件夹中。需要将`input_folder_path`和`output_folder_path`变量替换为实际的路径。