for i = 1:ncomp rslt(i).ncomp = i; cal_p = squeeze(cal_preds(i, :)); cal_p = mode(cal_p,1); cal_t = squeeze(cal_trues(i, :)); cal_t = mode(cal_t,1); [cal_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(cal_t, cal_p); cal_rslt = statsOfMeasure(cal_confus, 0); rslt(i).cal_confus = cal_confus; rslt(i).cal_rslt = cal_rslt; rslt(i).cal_acc = cal_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).cal_sen = cal_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).cal_spe = cal_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).cal_y_true = cal_t; rslt(i).cal_y_pred = cal_p; val_p = squeeze(val_preds(i, :)); val_t = squeeze(val_trues(i, :)); [val_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(val_t, val_p); val_rslt = statsOfMeasure(val_confus, 0); rslt(i).val_confus = val_confus; rslt(i).val_rslt = val_rslt; rslt(i).val_acc = val_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).val_sen = val_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).val_spe = val_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).val_y_true = val_t; rslt(i).val_y_pred = val_p; mdl = plsda(x_pp, y, i, opts0); trainedModel{i} = mdl; mdl = plsda(x_test_pp,[],i,mdl, opts0); rslt(i).probability = mdl.classification.probability; y_test_pred = mdl.classification.mostprobable; [test_confus, rslt_confusionOrder] = confusionmat(y_test, y_test_pred); test_rslt = statsOfMeasure(test_confus, 0); rslt(i).test_confus = test_confus; rslt(i).test_rslt = test_rslt; rslt(i).test_acc = test_rslt.microAVG(end-1); rslt(i).test_sen = test_rslt.microAVG(end-3); rslt(i).test_spe = test_rslt.microAVG(end-2); rslt(i).test_y_true = y_test; rslt(i).test_y_pred = y_test_pred; 什么意思

时间: 2024-02-19 17:01:10 浏览: 21
这段代码是一个 Matlab 程序,其中包含了一些变量的赋值和计算。程序的主要功能是进行多元统计分析,包括 PLS-DA 模型的建立和评估。其中,通过循环语句对每个组分 i 进行建模和评估,并将结果保存在结构体变量 rslt 中。程序中使用了混淆矩阵(confusion matrix)来评估分类模型的性能,并计算了准确率(accuracy)、灵敏度(sensitivity)、特异度(specificity)等指标。同时,程序还包括了测试集的预测和评估。
相关问题

function [trainedModel, rslt, sp] = plsdaKFolds(x, y,... ncomp,preprocess_methods, opts0, folds, x_test, y_test) N = size(y, 1); if isempty(preprocess_methods) preprocess_methods = preprocess('default','autoscale'); end [x_pp, sp] = preprocess('calibrate', preprocess_methods, x); x_test_pp = preprocess('apply', sp, x_test); y_logical = class2logical(y); class_cnts = size(y_logical,2); % Perform cross-validation KFolds = folds; cvp = cvpartition(size(y, 1), 'KFold', KFolds); % Initialize the predictions to the proper sizes % validationPredictions = zeros(N,ncomp); cal_preds = nan(ncomp, N); cal_trues = nan(ncomp, N); cal_probs = nan(ncomp, N, class_cnts); val_preds = nan(ncomp, N); val_trues = nan(ncomp, N); val_probs = nan(ncomp, N, class_cnts); % format = 'Fold: %d comp: %d;\n'; for fold = 1:KFolds x_cal = x(cvp.training(fold), :, :); y_cal = y(cvp.training(fold), :); [x_cal_pp, sp_cal] = preprocess('calibrate', preprocess_methods, x_cal); x_val = x(cvp.test(fold), :); x_val_pp = preprocess('apply', sp_cal, x_val); y_val = y(cvp.test(fold), :); % Train a regression model % This code specifies all the model options and trains the model. for i = 1:ncomp % fprintf(format,fold,i); %disp(tab); fprintf('-') mdl_cal = plsda(x_cal_pp, y_cal, i, opts0); mdl = plsda(x_cal_pp,[], i,mdl_cal, opts0); y_cal_pred = mdl.classification.mostprobable; cal_preds(i, cvp.training(fold)) = y_cal_pred; s = size(mdl.classification.probability, 2); cal_probs(i, cvp.training(fold), 1:s) = mdl.classification.probability; cal_trues(i, cvp.training(fold)) = y_cal; mdl = plsda(x_val_pp,[],i,mdl_cal, opts0); y_val_pred = mdl.classification.mostprobable; val_preds(i, cvp.test(fold)) = y_val_pred; s = size(mdl.classification.probability, 2); val_probs(i, cvp.test(fold), 1:s) = mdl.classification.probability; val_trues(i, cvp.test(fold)) = y_val; end end

这段代码实现了 PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis)交叉验证。它将输入数据分为训练集和测试集,对每个折叠的数据分别进行 PLS-DA 模型拟合和预测,最终得到每个组合(折叠和主成分数)的预测结果和真实标签。 具体来说,该函数的输入包括: - x: 输入数据,大小为 N×p,其中 N 是样本数,p 是特征数。 - y: 目标变量,大小为 N×1。 - ncomp: PLS-DA 的主成分数。 - preprocess_methods: 预处理方法。 - opts0: PLS-DA 的选项参数。 - folds: 折叠数,用于交叉验证。 - x_test, y_test: 测试集数据和标签。 该函数的输出包括: - trainedModel: 训练好的 PLS-DA 模型。 - rslt: 结果,包括训练和测试的预测结果和真实标签。 - sp: 预处理参数。 该函数的主要步骤如下: - 对输入数据进行预处理,包括校准和转换(calibrate)和应用(apply)。 - 将目标变量 y 转换为逻辑变量 y_logical,并计算类别数 class_cnts。 - 对数据进行 K 折交叉验证,每次迭代中使用一部分数据作为训练集,另一部分数据作为测试集。 - 在每个折叠的数据中,分别使用 PLS-DA 拟合模型,得到训练集和测试集的预测结果和真实标签。 - 将所有折叠的结果存储在 cal_preds、cal_probs、cal_trues、val_preds、val_probs 和 val_trues 中,并返回这些结果作为输出。

请解释 BETA2 = plsRegress(train_inst, train_lbl, ncomp)

这段代码是使用 PLS (Partial Least Squares) 方法对训练集进行回归分析,其中train_inst是训练数据,train_lbl是训练标签,ncomp是PLS模型中的主成分个数。 PLS是一种线性回归方法,它通过将自变量和因变量分别投影到一个或多个新的变量中,使得在这些新的变量上的相关性最大化。这些新的变量被称为主成分,通过这些主成分,PLS可以建立一个更加准确的线性回归模型。 plsRegress函数是用于执行 PLS 回归的函数,它的输出值beta2是回归系数,可以用于对测试集进行预测。

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