python 分别输出两行字符串,代表DNA的两条链上的碱基,输出其中有多少对碱基发生了病变
时间: 2024-02-13 20:04:46 浏览: 62
好的,以下是代码实现:
```python
# 假设两条DNA链分别为s1和s2
s1 = "ATCGATCG"
s2 = "ATCGAGCG"
# 逐个比较碱基是否相同,并计数
count = 0
for i in range(len(s1)):
if s1[i] != s2[i]:
count += 1
# 输出结果
print("DNA第一条链:", s1)
print("DNA第二条链:", s2)
print("共有", count, "对碱基发生了病变")
```
输出结果为:
```
DNA第一条链: ATCGATCG
DNA第二条链: ATCGAGCG
共有 1 对碱基发生了病变
```
注意,本代码只是简单的比较两个字符串中对应位置的字符是否相同,实际情况中可能需要更加复杂的处理。
相关问题
python1105:练7.7 配对碱基链
在Python编程中,配对碱基链是指将DNA序列中的碱基互补配对,即将“A”与“T”配对,“C”与“G”配对。练习7.7是要求编写一个程序,接受用户输入的DNA序列,然后输出其互补配对的结果。
首先,我们可以使用input函数接收用户输入的DNA序列,然后使用字符串操作方法将其转换为大写字母,以确保大小写不影响配对结果。接着,我们可以使用循环遍历DNA序列中的每个碱基,根据其配对规则,将其互补碱基加入到一个新的序列中。具体的代码可以如下所示:
```python
# 用户输入DNA序列
dna_sequence = input("请输入DNA序列:").upper()
# 创建空字符串存储互补配对结果
complementary_sequence = ""
# 循环遍历DNA序列,进行互补配对
for base in dna_sequence:
if base == "A":
complementary_sequence += "T"
elif base == "T":
complementary_sequence += "A"
elif base == "C":
complementary_sequence += "G"
elif base == "G":
complementary_sequence += "C"
else:
print("输入的DNA序列包含非法碱基!")
break
# 输出互补配对结果
print("互补配对的DNA序列是:", complementary_sequence)
```
通过以上代码,我们可以实现对用户输入的DNA序列进行互补配对,并输出配对后的结果。这样,练习7.7就可以得到满足。
给出一条字符串型DNA序列 DNAstr=“AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTCTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGC将序列转换为列表,统计列表中ACTG各个碱基类型的占比
首先,我们可以将给定的DNA序列转换为一个字符列表,然后遍历这个列表计算每个碱基"ACTG"的出现次数,并将其除以总长度得到占比。以下是Python的一个例子:
```python
# 定义DNA序列
DNAstr = "AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTCTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGC"
# 将字符串转换为字符列表
base_list = list(DNAstr)
# 初始化计数器
A_count = C_count = T_count = G_count = 0
# 遍历列表并统计ACTG各碱基的数量
for base in base_list:
if base == 'A':
A_count += 1
elif base == 'C':
C_count += 1
elif base == 'T':
T_count += 1
elif base == 'G':
G_count += 1
# 总长度
total_length = len(base_list)
# 计算占比
A_percent = (A_count / total_length) * 100 if total_length != 0 else 0
C_percent = (C_count / total_length) * 100 if total_length != 0 else 0
T_percent = (T_count / total_length) * 100 if total_length != 0 else 0
G_percent = (G_count / total_length) * 100 if total_length != 0 else 0
# 打印结果
print("A:", A_percent, "%")
print("C:", C_percent, "%")
print("T:", T_percent, "%")
print("G:", G_percent, "%")
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