请下详细介绍靶向蛋白质组学
时间: 2023-06-19 17:36:13 浏览: 103
靶向蛋白质组学是一种利用质谱技术分析蛋白质组学的方法,它通过选择性地寻找和分析特定的蛋白质或者蛋白质族群,来研究它们在生物体内的功能和代谢途径。
靶向蛋白质组学的主要步骤包括:
1. 选择靶标蛋白:根据研究需要,选择特定的蛋白质或者蛋白质族群作为研究目标。
2. 样品制备:将样品进行适当的前处理,如蛋白质提取、富集等,以便于后续的质谱分析。
3. 质谱分析:利用质谱技术对样品进行分析,常用的包括MALDI-TOF、ESI-MS等技术。通过质谱分析可以得到蛋白质的质量、序列信息等。
4. 数据分析:借助生物信息学工具对质谱数据进行处理和分析,比如蛋白质定量、鉴定、功能注释等。
靶向蛋白质组学在生命科学、药物研发等领域有着广泛的应用,如发现新的药物靶点、研究蛋白质相互作用、诊断和治疗疾病等。
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靶向蛋白质组学SRM MRM
SRM (Selected Reaction Monitoring) 和 MRM (Multiple Reaction Monitoring) 是两种靶向蛋白质组学技术。它们通过质谱分析技术对特定蛋白质进行定量分析,可以用于检测蛋白质的表达水平和修饰状态。其中,SRM 主要针对单个蛋白质的定量分析,而 MRM 则可以同时对多个蛋白质进行定量分析。这两种技术在生物医学研究和临床诊断中有着广泛的应用前景。
2型糖尿病发病是环境因素与遗传因素相互作用的结果,已被鉴定与其相关的基因超过400个,这些基因也与肥胖、脂代谢紊乱和心血管病等密切相关。然而,目前检测出来的许多基因突变是低频率、罕见的变异,它们对总体疾病发生风险的作用尚未完全阐明,也缺乏相对应的靶向药物。 本研究主要是在前期研究基础上,期望能通过对个体基因组、蛋白质组、代谢组和临床表型的信息等进行多组学数据深度挖掘 (OWAS-DM),利用GWAS关联的孟德尔遗传-蛋白组量化性状基因座 (MR-pQTL),MR-mQTL (代谢组),MR-eQTL (表型组) 共定位分析及生物信息学分析等多组学分析策略,发现2型糖尿病发生发展的潜在机制及标志物。并利用cMAP及分子对接等人工智能虚拟筛选技术结合基于实验的亲和质谱、表面等离子共振及高内涵等筛选技术,发展针对2型糖尿病靶标的高通量药物筛选技术,为糖尿病患者的个体化精准诊断和治疗提供新的手段。翻译成英文
This study is based on previous research and expects to find the potential mechanism and biomarkers of the onset and development of type 2 diabetes through deep mining of multi-omics data such as individual genomes, proteomes, metabolomes, and clinical phenotypes (OWAS-DM), quantitative trait loci (MR-pQTL, MR-mQTL, MR-eQTL) associated with GWAS, and bioinformatics analysis. In addition, artificial intelligence virtual screening techniques such as cMAP and molecular docking, combined with experimental affinity mass spectrometry, surface plasmon resonance, and high-content screening techniques are used to develop high-throughput drug screening techniques for type 2 diabetes targets, providing new means for individualized and precise diagnosis and treatment of diabetes patients.
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