linux环境下文件夹内有n个fasta文件，每个文件序列名有例如>nad7_BJZWY01,>rpl16_ZCY139,>ZCY139等，我想把它们换成>BJZWY01,>ZCY139,>ZCY139，该如何编写命令？

您可以通过以下命令将文件夹内所有fasta文件中的序列名进行替换：

for file in *.fasta; do sed -i 's/>\([a-zA-Z0-9]\+\)_/>/g' "$file"; done

这个命令会遍历文件夹中所有的fasta文件，并对每个文件执行sed命令。sed命令会将每个序列名的前缀（例如"nad7_"）替换为">"，从而得到所需的序列名。