line1_list = [list(line.coords) for line in line1],Traceback (most recent call last): File "E:\code-study\coda\test.py", line 29, in <module> line1_list = [list(line.coords) for line in line1] TypeError: 'MultiLineString' object is not iterable

时间: 2024-02-17 09:04:12 浏览: 167
这个错误是因为你尝试对一个 MultiLineString 对象进行迭代操作,但是 MultiLineString 对象并不支持迭代。你需要首先将 MultiLineString 对象转换成 LineString 对象,然后再进行迭代操作。具体的方法可以参考下面的代码: ```python from shapely.geometry import MultiLineString # 创建一个 MultiLineString 对象 multi_line = MultiLineString([[(0, 0), (1, 1)], [(2, 2), (3, 3)]]) # 将 MultiLineString 对象转换成 LineString 对象 line_list = list(multi_line) # 对 LineString 对象进行迭代操作 coords_list = [list(line.coords) for line in line_list] print(coords_list) ``` 输出结果为: ``` [[(0.0, 0.0), (1.0, 1.0)], [(2.0, 2.0), (3.0, 3.0)]] ``` 这里我们首先将 MultiLineString 对象转换成了 LineString 对象,然后再对 LineString 对象进行迭代操作,得到了每条线段的坐标列表。
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if use_temporal: self.num_ttokens = num_ttokens self.temporal_position_bias_table = nn.Parameter(torch.zeros(2 * num_ttokens - 1, num_heads)) trunc_normal_(self.temporal_position_bias_table, std=.02) t_coords = torch.arange(num_ttokens) t_relative_coords = t_coords[:, None] - t_coords[None, :] t_relative_coords += num_ttokens - 1 t_relative_coords = t_relative_coords.view(-1) self.register_buffer("t_relative_coords", t_relative_coords)

这段代码是在定义一个Transformer模型的时候使用的,其中包含了对时间序列的处理。首先,如果use_temporal为True,则表示这个模型需要考虑时间维度的信息。num_ttokens表示时间序列的长度,temporal_position_bias_table是一个形状为(2*num_ttokens-1, num_heads)的可学习参数,用于在self-attention计算中加入时间维度的信息。trunc_normal_用于将temporal_position_bias_table进行初始化。接下来,t_coords表示时间序列的坐标,而t_relative_coords则表示时间序列中每个时间点与其他时间点之间的相对距离,t_relative_coords的形状为(num_ttokens, num_ttokens),其中每个元素都是一个相对距离值。我们将t_relative_coords的形状变为一维,以便在后续计算中使用。最后,使用register_buffer将t_relative_coords注册为一个buffer,这样它就可以在模型的前向计算中被使用。

class Attention(nn.Module): def __init__(self, dim, num_ttokens, num_heads=8, qkv_bias=False, qk_scale=None, attn_drop=0., proj_drop=0., with_qkv=True): super().__init__() self.num_heads = num_heads head_dim = dim // num_heads self.scale = qk_scale or head_dim ** -0.5 self.with_qkv = with_qkv if self.with_qkv: self.qkv = nn.Linear(dim, dim * 3, bias=qkv_bias) self.proj = nn.Linear(dim, dim) self.proj_drop = nn.Dropout(proj_drop) self.attn_drop = nn.Dropout(attn_drop) ## relative position bias self.num_ttokens = num_ttokens self.relative_position_bias_table = nn.Parameter(torch.zeros(2 * num_ttokens - 1, num_heads)) trunc_normal_(self.relative_position_bias_table, std=.02) coords = torch.arange(num_ttokens) relative_coords = coords[:, None] - coords[None, :] relative_coords += num_ttokens - 1 relative_coords = relative_coords.view(-1) self.register_buffer("relative_coords", relative_coords)

这是一个实现了注意力机制的神经网络模块,主要用于处理输入序列中不同位置之间的关系。其中,dim代表输入特征的维度,num_ttokens表示输入序列的长度,num_heads表示注意力头数,qkv_bias表示是否对注意力中的查询、键、值进行偏置,qk_scale表示缩放因子,attn_drop表示注意力中的dropout率,proj_drop表示输出结果的dropout率,with_qkv表示是否需要对输入进行线性变换。 在实现中,首先根据输入的维度和头数计算每个头的维度head_dim,然后根据缩放因子scale对查询、键、值进行线性变换,得到每个头的查询、键、值向量。如果with_qkv为True,则需要对输入进行线性变换得到查询、键、值向量;否则直接使用输入作为查询、键、值向量。 接着,计算注意力分数,即将查询向量和键向量点乘并除以缩放因子scale,然后通过softmax函数得到注意力权重。将注意力权重与值向量相乘并进行加权平均,得到最终的输出结果。 另外,为了考虑不同位置之间的关系,在实现中还引入了相对位置编码。具体来说,通过计算每个位置之间的相对距离,得到一个相对位置编码矩阵,然后将其转化为一个参数relative_position_bias_table,并通过注册buffer的方式保存在模块中。在计算注意力分数时,将查询向量和键向量的相对位置编码相加,从而考虑不同位置之间的相对关系。
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def cell_counter(image, min_area=20): """细胞计数""" # for s in image: df = pd.DataFrame() image =cv2.imread(image) gray = cv2.cvtColor(image, cv2.COLOR_BGR2GRAY) ret, thresh = cv2.threshold(gray, 100, 255, cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU) kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (3, 3)) opening = cv2.morphologyEx(thresh, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=2) distance = ndi.distance_transform_edt(opening) coords = peak_local_max(distance, min_distance=9, footprint=np.ones((7, 7)), labels=opening) mask = np.zeros(distance.shape, dtype=bool) mask[tuple(coords.T)] = True markers, _ = ndi.label(mask) labels = watershed(-distance, markers, mask=opening, watershed_line=True) labels_area = [region.area for region in regionprops(labels) if region.area > min_area] cell_num = len(labels_area) print(cell_num) df = df.append(pd.DataFrame({(file_path,cell_num)}, index=[0]), ignore_index=True) print(df) # return cell_num # df.to_excel('1.xlsx', index=False) if __name__ == '__main__': path = r'D:\0531test' slide_path = os.listdir(path) # df =pd.DataFrame(slide_path) # df.to_excel('1.xlsx',index=False) for i in slide_path: slide_name = os.path.basename(i) #slide_name 样本名称 file_path = os.path.join(path,slide_name) images = os.listdir(file_path) f = glob.glob(os.path.join(file_path, '*.jpg')) for image in f: # print(s) # for s in images: # image_name = os.path.basename(s) # name = image_name.replace('.jpg','') # df = df.append(pd.DataFrame({(file_path,name[:-8])}, index=[0]), ignore_index=True) cell_counter(image) # df.to_excel('1.xlsx',index=False)

Traceback (most recent call last): File "symmetry.py", line 17, in <module> centers = C_coords[np.random.choice(C_coords.shape[0], size=n_clusters, replace=False)] File "mtrand.pyx", line 903, in numpy.random.mtrand.RandomState.choice ValueError: a must be greater than 0 unless no samples are taken。import numpy as np from scipy.spatial.distance import cdist # 读取POSCAR文件 with open('69_POSCAR', 'r') as f: lines = f.readlines() # 提取晶格矢量和C原子坐标 lattice = np.array([list(map(float, lines[i].split())) for i in range(2, 5)]) coords = np.array([list(map(float, line.split())) for line in lines[8:]]) # 提取C原子的坐标 C_coords = coords[coords[:, 2] == 6][:, :3] # 初始化聚类中心 n_clusters = 3 centers = C_coords[np.random.choice(C_coords.shape[0], size=n_clusters, replace=False)] # 迭代聚类 max_iter = 100 for i in range(max_iter): # 计算每个C原子到聚类中心的距离 distances = cdist(C_coords, centers) # 分配聚类标签 labels = np.argmin(distances, axis=1) # 更新聚类中心 for j in range(n_clusters): centers[j] = np.mean(C_coords[labels == j], axis=0) # 输出聚类结果和聚类中心 print('C原子聚类结果:') for i in range(len(C_coords)): print('C{}: ({:.3f}, {:.3f}, {:.3f}),聚类标签:{}'.format( i+1, C_coords[i][0], C_coords[i][1], C_coords[i][2], labels[i]+1)) print('聚类中心:') for i in range(len(centers)): print('聚类{}中心:({:.3f}, {:.3f}, {:.3f})'.format(i+1, centers[i][0], centers[i][1], centers[i][2]))。修改代码。

file = gpd.read_file(r"E:\code-study\class-test\test.geojson") #获取每条线段的端点坐标 for index,row in file.iterrows(): if row["geometry"].geom_type == "MultiLineString": for line in row["geometry"].geoms: start = line.coords[0] end = line.coords[-1] print("Line start:", start) print("Line end", end),Line start: (345888.8377459495, 3449498.849251645) Line end (345629.97464499675, 3449407.506965276) Line start: (345280.09157031064, 3449030.0337291397) Line end (345272.49128222495, 3449049.808989464) Line start: (345272.49128222495, 3449049.808989464) Line end (345207.97659461905, 3449222.778335579) Line start: (346000.16949852963, 3449534.6728273346) Line end (345945.905299675, 3449515.56654852) Line start: (345912.594155262, 3449503.8347858437) Line end (345630.9943146321, 3449404.431732289) Line start: (346072.48027534503, 3450395.8932189597) Line end (346108.97338958416, 3450251.398985895) Line start: (346118.59858503146, 3450213.518651368) Line end (346259.0512482276, 3449646.0243423935) Line start: (346273.0178897714, 3449593.106077165) Line end (346335.5867677608, 3449370.609103672) Line start: (346265.8854519349, 3449647.9424282) Line end (346122.1064710339, 3450214.6475669923) Line start: (346112.2891860679, 3450252.2834272203) Line end (346075.36625823507, 3450396.1075029722) Line start: (345411.5247303593, 3450021.971671897) Line end (345556.4158206382, 3450076.3672987036) Line start: (345517.817400123, 3450059.154634558) Line end (345770.503485893, 3450140.345187006) Line start: (345804.2092067172, 3450150.3849952365) Line end (345874.2574445517, 3450167.3248460926) Line start: (345924.80312931805, 3450186.197005902) Line end (346102.13061896793, 3450230.692243254) Line start: (345766.5523878782, 3450156.3483928964) Line end (345409.48140833457, 3450028.96165739) Line start: (346069.2903592914, 3450395.792547785) Line end (346105.8483254915, 3450250.5602219505) Line start: (346115.2730931371, 3450212.4484372856) Line end (346255.98977489606, 3449645.165328472) Line start: (346269.80789709534, 3449591.9630052154) Line end (346332.0645057148, 3449369.94193096) Traceback (most recent call last): File "E:\code-study\coda\cross_nostopline.py", line 10, in <module> if row["geometry"].geom_type == "MultiLineString": AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'geom_type'

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