根据节点的坐标计算knot energy的matlab代码

假设你已经有了节点的坐标矩阵`X`，每行代表一个节点的坐标，那么可以按照以下代码计算knot energy：

function E = calc_knot_energy(X)
% 计算节点坐标矩阵X的knot energy

n = size(X, 1);  % 节点个数

% 计算节点之间的距离矩阵
dist = squareform(pdist(X));

% 计算knot energy
E = 0;
for i = 1:n-1
    for j = i+1:n
        E = E + log(dist(i,j));
    end
end

注意，这里计算的是无向图的knot energy，即节点之间的距离是对称的。如果需要计算有向图的knot energy，需要在`for`循环中只考虑一半的节点对。