写一个matlab的层次聚类实现
时间: 2024-03-28 14:11:34 浏览: 11
以下是一个基本的 MATLAB 层次聚类实现:
```matlab
% 生成样本数据
X = randn(100, 10);
% 计算距离矩阵
D = pdist(X);
% 进行层次聚类
Z = linkage(D);
% 绘制聚类树状图
dendrogram(Z);
% 根据聚类树状图确定聚类数目
T = cluster(Z, 'MaxClust', 5);
% 绘制聚类结果图
scatter3(X(:,1), X(:,2), X(:,3), 10, T);
```
该代码首先生成了一个 100 行 10 列的随机矩阵 X,然后使用 pdist 函数计算距离矩阵 D,接着使用 linkage 函数进行层次聚类,得到聚类树状图 Z。然后,可以使用 dendrogram 函数绘制聚类树状图。接着,可以根据聚类树状图确定聚类数目,例如,这里将聚类数目设为 5,使用 cluster 函数进行聚类,并使用 scatter3 函数绘制聚类结果图。
相关问题
编写一个层次聚类的matlab实现
层次聚类是一种基于距离的聚类方法,它将数据点组织成一棵树形结构,其中每个节点代表一个聚类,树的根节点代表所有数据点的聚类。
下面是一个基于欧氏距离的层次聚类的Matlab实现示例:
```matlab
% 生成随机数据
data = rand(10, 3);
% 计算数据点之间的距离矩阵
distances = pdist(data);
% 使用平均链接(average linkage)方法进行层次聚类
Z = linkage(distances, 'average');
% 将层次聚类结果可视化为树形结构
dendrogram(Z);
% 根据设定的聚类数目,将数据点划分到不同的聚类中
num_clusters = 3;
idx = cluster(Z, 'maxclust', num_clusters);
% 可视化聚类结果
figure;
scatter3(data(:,1), data(:,2), data(:,3), 10, idx, 'filled');
```
在上面的代码中,我们首先生成了一个包含10个数据点和3个特征的随机数据集,然后使用`pdist`函数计算数据点之间的欧氏距离矩阵。接下来,我们使用`linkage`函数将距离矩阵转化为层次聚类树,并选择了平均链接方法。然后,我们使用`dendrogram`函数可视化了层次聚类树。最后,我们使用`cluster`函数将数据点划分到不同的聚类中,并使用`scatter3`函数可视化了聚类结果。
需要注意的是,层次聚类的时间复杂度较高,通常适用于小数据集。对于大数据集,可以考虑使用K均值聚类等其他聚类算法。
matlab 层次聚类
在Matlab中进行层次聚类可以使用多个函数,其中包括pdist、linkage、dendrogram、cluster、clusterdata、cophenet和inconsistent等函数。这些函数可以帮助我们完成层次聚类的过程。具体来说,使用pdist函数可以计算数据之间的距离,linkage函数将距离矩阵转化为一个树状结构,dendrogram函数用于绘制聚类结果的树状图,cluster函数用于执行聚类操作,clusterdata函数可以将数据集进行聚类处理,cophenet函数可以计算层次聚类的相关系数,inconsistent函数可以计算聚类的不一致性。根据引用内容和,这些函数可以在Matlab中使用来实现层次聚类算法。而引用中提到的是一份简单明了的层次聚类算法的笔记内容,其中的代码在Matlab R2015b版本上进行了验证并且可行。