PET成像计算出的SUV的mat格式转为nii格式代码
时间: 2023-05-29 22:07:12 浏览: 269
基于MRI成像下的人体脊柱(spine)3D分割数据集(nii.gz格式)
这里提供一个Python的代码示例,使用Pydicom和NiBabel库来实现PET成像计算出的SUV的mat格式转为nii格式:
```
import numpy as np
import pydicom
import nibabel as nib
# 读取mat格式数据
mat_data = np.loadtxt('SUV.mat')
# 读取PET图像的Dicom信息
pet_dicom = pydicom.dcmread('PET.dcm')
# 获取PET图像的像素尺寸和像素间距
pixel_spacing = pet_dicom.PixelSpacing
slice_thickness = pet_dicom.SliceThickness
# 将mat数据转换为nii格式数据
suv_nii = nib.Nifti1Image(mat_data, affine=np.diag([pixel_spacing[0], pixel_spacing[1], slice_thickness, 1]))
# 保存nii格式数据
nib.save(suv_nii, 'SUV.nii')
```
这个代码示例假设PET图像的DICOM文件名为“PET.dcm”,SUV值的mat格式数据文件名为“SUV.mat”,并且保存的nii文件名为“SUV.nii”。请根据自己的情况修改文件名和路径。
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