seqtk subseq /home/DuYD/20220326_JNILI/JN_2023_trinity.fa /home/DuYD/0531list/JN_2023_grep_trinity.list_new > /home/DuYD/seqtk_fasta/JN_2023_subseq.fa运行后，JN_2023_subseq.fa文件里有10条序列信息，怎么根据序列号把结果拆成十个fa文件

你可以使用下面的命令将JN_2023_subseq.fa文件中的每个序列拆分成单独的fa文件：

awk '/^>/{s=++d".fa"} {print > s}' JN_2023_subseq.fa

这个命令会根据每个序列的头部（以">"开头）将序列分割成多个文件，文件名为数字.fa。你可以根据需要修改文件名。

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seqtk subseq /Analysis_B/20220326_JNILI/004_Trinity/${j}_trinity.fa /home/DuYD/0530/grep/${j}_new_grep_trinity.list > /home/DuYD/0530/seqtk_fasta/${j}_subseq.fasta bash: seqtk: command not found... 怎么回事

这个错误提示是因为系统中没有安装seqtk命令，需要先安装seqtk才能使用该命令。

你可以按照以下步骤安装seqtk：

1. 下载seqtk源码包：可以从seqtk的官方网站下载源码包。

2. 解压源码包：将下载的源码包解压到你想要安装的目录中。

3. 编译seqtk：进入解压后的seqtk目录，执行make命令进行编译。

4. 安装seqtk：执行make install命令进行安装。

安装完成后，再次执行seqtk命令即可。

另外，如果你使用的是conda环境，可以使用conda install seqtk命令进行安装。

(base) [DuYD@node01 seqtk_fasta]$ awk '/^>/{s="/home/DuYD/0531list1/JN_2023/"substr($0,2) ".fa"} {print > s}' /home/DuYD/seqtk_fasta/JN_2023_subseq.fa awk: fatal: cannot open file `/home/DuYD/seqtk_fasta/JN_2023_subseq.fa' for reading (No such file or directory)怎么回事

这个错误提示说明你无法打开文件`/home/DuYD/seqtk_fasta/JN_2023_subseq.fa`，很可能是因为该文件不存在或者文件路径不正确。你在运行`awk`命令时指定了输出文件的路径为`/home/DuYD/0531list1/JN_2023/`，请先检查该路径下是否存在`JN_2023_subseq.fa`这个文件，或者检查文件路径是否正确。