chart.Correlation(data1, histogram=TRUE, pch=19)
时间: 2023-07-19 08:27:26 浏览: 94
这是一个 R 语言的代码,它的作用是绘制数据框 data1 中所有列两两之间的 Pearson 相关系数矩阵热力图,并在对角线位置绘制每个变量的直方图。具体来说,这个代码使用了 PerformanceAnalytics 包中的 chart.Correlation() 函数,并传递了以下参数:
- data1:表示要分析的数据框。
- histogram=TRUE:表示在对角线位置绘制每个变量的直方图。
- pch=19:表示散点图的点形状为实心圆。
通过这个代码,我们可以快速地了解数据框中不同变量之间的相关性,同时也可以查看每个变量的分布情况。这对于我们在进行数据分析和建模时,有很大的帮助。
相关问题
chart.Correlation
chart.Correlation是一个R语言中的函数,用于绘制相关性矩阵的可视化图表。它可以通过使用PerformanceAnalytics包来实现。在使用之前,需要先安装PerformanceAnalytics包。函数的语法如下所示:
chart.Correlation(data, histogram = TRUE, pch = 19)
其中,data是一个数据框或矩阵,表示要进行相关性分析的数据集。histogram参数用于指定是否在图表中包含直方图,默认为TRUE。pch参数用于指定散点图中的点的形状,默认为19。\[1\]\[2\]
这个函数可以生成一个直观、简洁的相关性矩阵图表,可以帮助我们更好地理解数据之间的相关性关系。如果需要保存相关性矩阵,可以使用write.table函数将其保存为文件,如下所示:
write.table(cor_matr, file = "cor_matr.xls", row.names = FALSE, col.names = TRUE, quote = FALSE, sep = "\t")
其中,cor_matr是相关性矩阵的数据对象。保存为.xls文件时,可以使用tab分隔符作为列分隔符。\[3\]
如果你想绘制一个下三角的热图,可以使用corrplot包来实现,如下所示:
library(corrplot)
corrplot(cor_matr, type = "lower", order = "hclust", tl.col = "black", tl.srt = 45)
这个函数可以根据相关性矩阵绘制一个下三角的热图,其中type参数指定绘制的类型为lower,order参数指定使用层次聚类对相关性矩阵进行排序,tl.col参数指定刻度标签的颜色,tl.srt参数指定刻度标签的旋转角度。\[3\]
#### 引用[.reference_title]
- *1* [R语言:修改chart.Correlation()函数绘制相关性图——完美出图](https://blog.csdn.net/weixin_44510686/article/details/113704202)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
- *2* *3* [chart.Correlation绘制相关性热图](https://blog.csdn.net/weixin_43949246/article/details/105396382)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v91^insertT0,239^v3^insert_chatgpt"}} ] [.reference_item]
[ .reference_list ]
import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns from pandas_profiling import ProfileReport from sklearn import datasets from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import StandardScaler data=pd.read_csv('H:/analysis_results/mean_HN.csv') columns=['folder', 'volume', 'convex_volume', 'surface_area','length','max_width', 'max_depth'] data.head() values=data.iloc[:,1:7] correlation=values.corr() fig,ax=plt.subplots(figsize=(12,10)) sns.heatmap(correlation,annot=True,annot_kws={'size':16},cmap='Reds',square=True,ax=ax) sns.pairplot(data,hue='folder') plt.show()出现报错`import pandas_profiling` is going to be deprecated by April 1st. Please use `import ydata_profiling` instead. from pandas_profiling import ProfileReport,如何修改
你可以修改为以下代码来使用ydata_profiling:
```python
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
from ydata_profiling import ProfileReport
from sklearn import datasets
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
data=pd.read_csv('H:/analysis_results/mean_HN.csv')
columns=['folder', 'volume', 'convex_volume', 'surface_area','length','max_width', 'max_depth']
data.head()
values=data.iloc[:,1:7]
correlation=values.corr()
fig,ax=plt.subplots(figsize=(12,10))
sns.heatmap(correlation,annot=True,annot_kws={'size':16},cmap='Reds',square=True,ax=ax)
sns.pairplot(data,hue='folder')
profile = ProfileReport(data, title='Pandas Profiling Report', html={'style':{'full_width':True}})
profile.to_notebook_iframe()
plt.show()
```
这里使用 `ydata_profiling` 替代 `pandas_profiling`,并且在最后添加了Pandas Profiling报告的代码。