linux上blast命令

在Linux上使用blast命令，需要先安装blast软件包，具体操作如下：

1. 打开终端窗口，使用以下命令更新软件包列表：

sudo apt-get update

2. 使用以下命令安装blast软件包：

sudo apt-get install ncbi-blast+

3. 安装完成后，使用以下命令检查blast是否正常运行：

blastn -version

如果出现blastn的版本信息，则说明安装成功。

4. 使用以下命令运行blast命令：

blastn -query query.fasta -db database.fasta -out output.txt

其中，query.fasta是查询序列文件，database.fasta是参考序列文件，output.txt是输出结果文件。

以上就是在Linux上使用blast命令的基本操作流程。